• Türkçe
    • English
  • English 
    • Türkçe
    • English
  • Login
View Item 
  •   DSpace@MKU
  • Fakülteler
  • Veteriner Fakültesi
  • Makale Koleksiyonu
  • View Item
  •   DSpace@MKU
  • Fakülteler
  • Veteriner Fakültesi
  • Makale Koleksiyonu
  • View Item
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Is total RNA extraction possible from small volume goat milk (7.5 mL) for RT-qPCR studies ?

Thumbnail

View/Open

Tam Metin / Full Text (830.2Kb)

Access

info:eu-repo/semantics/openAccess

Date

2018

Author

Eraslan Şakar, Aysel
Özkan, Hüseyin
Yakan, Akın

Metadata

Show full item record

Citation

Șakar, A. E., Özkan, H., & Yakan, A. (2018). Is total RNA extraction possible from small volume goat milk (7.5 mL) for RT-qPCR studies?. Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 65(1), 57-61.

Abstract

This study aimed to study the application availability of RT-qPCR by total RNA extraction from small volumes of milk samples. RNA was extracted from 7,5 mL milk. Amount and quality of RNA and Ct results obtained via RT-qPCR were compared with the values obtained from 100 mL milk. A260/A280 ratio of absorbance was found to be higher than 1,70 in all samples. Mean RNA purity were identified as ,87±0,07 and 1,77±0,01 in 7,5 mL and 100 mL milk samples respectively. While mean total RNA concentration was 149,37±43,40 μg/mL in 7,5 mL milk sample, it was measured to be 309,03±77,82 μg/mL in 100 mL milk sample. Mean somatic cell count (SCC) of the 8 goats used in the study was calculated as 486,37±185,68 x 103 cells/mL. Ribosomal Protein Lateral Stalk Subunit P0 (RPLP0) gene which is accepted as the reference gene in goat somatic cells was used to test application availability of obtained RNA in RT-qPCR. Mean Ct results were found to be 20,33±0,39 and 19,51±0,41 in 7,5 mL and 100 mL groups respectively, creating no difference between the two groups (P = 0,170). Quality and amount of obtained RNA and Ct results showed that it was possible to extract RNA by using 7,5 mL milk.
 
Bu çalışmada küçük hacimlerdeki süt örneklerinden total RNA izolasyonu yapılarak, RT-qPCR çalışmalarının yapılabilirliğinin araştırılması amaçlanmıştır. Bunun için 7,5 mL sütten RNA izole edilmiş; RNA miktarı, kalitesi ve RT-qPCR’dan elde edilen Ct sonuçları 100 mL sütten elde edilen değerlerle karşılaştırılmıştır. Kullanılan bütün örneklerde A260/A280 absorbans oranı 1,70’ten büyük, RNA saflığının ortalaması 7,5 mL örnek grubunda 1,87±0,07, 100 mL örnek grubunda 1,77±0,01 olarak tespit edilmiştir. Total RNA konsantrasyonunun ortalaması 7,5 mL örnek grubunda 149,37±43,40 μg/mL iken, 100 mL örnek grubunda 309,03±77,82 μg/mL olarak ölçülmüştür. Kullanılan 8 keçinin somatik hücre sayısının (SCC) ortalaması ise 486,37±185,68 x 103 olarak hesaplanmıştır. Elde edilen RNA’ların RT-qPCR’da kullanılabilirliğini test etmek için keçi süt somatik hücrelerinde referans gen olarak kabul edilen Ribosomal Protein Lateral Stalk Subunit P0 (RPLP0) geni kullanılmıştır. 7,5 mL grubunda Ct sonuçlarının ortalaması 20,33±0,39, 100 mL grubunda 19,51±0,41 olarak bulunmuş olup, iki grup arasında bir fark oluşmamıştır (P=0,170). Elde edilen RNA’nın miktarı, kalitesi ve Ct sonuçları 7,5 mL süt kullanılarak da RNA izolasyonu yapılabileceğini göstermiştir.
 

Source

Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi

Volume

65

Issue

1

URI

https://dx.doi.org/10.1501/Vetfak_0000002827
https://hdl.handle.net/20.500.12483/122

Collections

  • Makale Koleksiyonu [4]



DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Contact Us | Send Feedback
Theme by 
@mire NV
 

 




| Policy | Guide | Contact |

DSpace@Hatay

by OpenAIRE
Advanced Search

sherpa/romeo

Browse

All of DSpaceCommunities & CollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsTypeDepartmentPublisherCategoryLanguageAccess TypeThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsTypeDepartmentPublisherCategoryLanguageAccess Type

My Account

LoginRegister

Statistics

View Google Analytics Statistics

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Contact Us | Send Feedback
Theme by 
@mire NV
 

 


|| Policy || Guide || Library || Hatay Mustafa Kemal University || OAI-PMH ||

Hatay Mustafa Kemal University, Hatay, Turkey
If you find any errors in content, please contact:

Creative Commons License
Hatay Mustafa Kemal University Institutional Repository is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 4.0 Unported License..

DSpace@Hatay:


DSpace 6.2

tarafından İdeal DSpace hizmetleri çerçevesinde özelleştirilerek kurulmuştur.