Investigation of toxin genes in staphylococcus aureus strains isolated in Mustafa Kemal University Hospital

Abstract

Aim: Th e aim of this study was to investigate the presence of genes encoding staphylococcal enterotoxins (SEs), exfoliative toxins (ETAs, ETBs), and toxic shock syndrome toxin-1 (TSST-1) by polymerase chain reaction (PCR) in Staphylococcus aureus strains isolated from various clinical samples from the Mustafa Kemal University Hospital. In addition, PCRbased restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of the coa gene was employed to genotype the isolates. Materials and methods: A total of 120 S. aureus strains isolated from various clinical samples (blood, wounds, urine, conjuctival swabs, and tracheal aspirate) over a 1 year period, 2007-2008, were used in this study. Results: Almost 65.8% of the isolates possessed at least one toxin gene. Th e genes most frequently found were seg-sei (40.8%), followed by sea (30%) and eta (19.2%). Overall, 35 toxin genotypes were observed, among which the genotypes seg-sei, sea-seg-sei, and sea-see predominated at the rate of 8.3%, 5.8%, and 5%, respectively. Four coagulase genotype patterns were observed, with molecular sizes ranging from 570 to 970 bp. Coa-based RFLP analysis revealed 7 diff erent patterns using AluI. Conclusion: Our results have revealed that toxin genes were very prevalent among S. aureus isolates, and the toxigenic isolates were independent of the genotypes obtained by PCR-RFLP of the coa gene (P > 0.05).

Amaç: Bu çalışmanın amacı Mustafa Kemal Üniversitesi Hastanesi’nde farklı klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında stafi lokokkal enterotoksinler (SE), eksfoliyatif toksinler (ETA, ETB) ve toksik şok sendrom toksin-1’i (TSST-1) kodlayan genlerin Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile belirlenmesi ve koagulaz genine dayalı restriction fragment length polymorphism (PZR-RFLP) ile tiplendirilmesidir. Yöntem ve gereç: Çalışmada farklı klinik örneklerden (kan, yara, idrar, konjuktival sürüntü örneği ve trakeal aspirat) 2007-2008 yılları arasında izole edilen 120 S. aureus suşu kullanıldı. Bulgular: İzolatların % 65,8’inin en az bir toksin geni taşıdığı saptandı. En yaygın toksin genlerinin seg-sei (% 40,8), sea (% 30) ve eta (% 19,2) olduğu tespit edildi. Çalışmada 35 toksin genotipinden, seg-sei (% 8.3), sea-seg-sei (% 5,8) ve sea-see (% 5) en yaygın genotipler olarak belirlendi. Moleküler büyüklükleri 570-970 bp arasında değişen 4 koagulaz genotipi gözlendi. Koagulaz geninin AluI ile kesilmesi ile yapılan RFLP analizi ile 7 farklı pattern bulundu. Sonuç: S. aureus izolatları arasında toksin genlerinin oldukça yaygın olduğu ve toksijenik suşların coa genine dayalı yapılan PZR-RFLP ile elde edilen genotiplerden bağımsız olduğu sonucuna varılmıştır (P > 0,05).