Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV) status in Turkey and sensitive detection using advanced techniques

Abstract

Sert çekirdekli meyve yetiştiriciliğinin Türkiye'de, Doğu Anadolu Bölgesi dışında, yoğun olduğu bölgelerde Elma klorotik yaprak lekesi virüsü (ACLSV)'nün yaygınlığı araştırılmıştır. Toplanan tüm virüs simptomu gösteren kiraz, şeftali, nektarin, kayısı ve erik örnekleri DAS-EL1SA ve revers transkripsiyon polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) tekniği ile test edilmiştir. 369 bitki örneğinin arasından 13 ağacın ACLSV ile enfekteli olduğu ELİSA ile tespit edilmiştir. Diğer taraftan, RT-PCR 51 pozitif ortaya koymuştur. En yüksek ACLSV infeksiyon oranı Bursa'dan temin edilen örneklerde (% 64) tespit edilmiş, bunu Yalova (% 20.51), Burdur (% 18.18), Amasya (% 13.43), Afyon (% 12.07), İsparta (% 6.25), Çanakkale (% 4.76) ve İzmir (% 2.72)'den toplanan örnekler izlemiştir. Araştırmada kullanılan sert çekirdekli meyve türleri arasında, nektarin en çok enfektelenen tür olarak tespit edilmiştir, bunu kayısı, şeftali, vişne, erik ve kiraz takip etmiştir. Bazı ACLSV izolatları immun olarak yakalanmış (İC) RT-PCR sisteminin uygulanmasında kullanılmıştır. Bitki ekstraktının 1:10 oranına'kadar sulandırılmasında 1C-RT-PCR ile teşhis yapılmıştır. Bu çalışmada, ülkemizdeki sert çekirdekli meyve ağaçlarındaki ACLSV'nün doğru ve hızlı teşhisinde RT-PCR ve IC-RT-PCR'ın başarılı bir şekilde uygulaması ortaya konmuştur.

The prevalence of apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV) was investigated in all the main stone fruit growing areas of Turkey except for East Anatolia. Three hundred and sixty-nine plant samples showing virus related symptoms were collected from sweet and sour cherry, peach, nectarine, apricot and plum trees. All samples were tested using DAS-ELISA and reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). Thirteen samples were detected as infected with ACLSV using ELISA while RT-PCR revealed 51 positive samples. The highest ACLSV incidence was in Bursa (64%), followed by Yalova (20.51%), Burdur (18.18%), Amasya (13.43%), Afyon (12.07%), Isparta (6.25%), Çanakkale (4.76%) and İzmir (2.72%). Among the collected stone fruit species, nectarine was the most infected species, followed by apricot, peach, sour cherry, plum and sweet cherry. Some ACLSV isolates were used for the adoption of an immuno capture (IC) RT-PCR system. ACLSV infected plant sap diluted up to 1:10 was detected by IC-RT-PCR. The successful application of RT-PCR and IC-RT-PCR for the accurate and sensitive detection of ACLSV was reported in stone fruit trees in Turkey.