Yazar "Şekerci, Akife Dalda" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim
    Öğe
    Microsatellite analysis in some watermelon (Citrullus lanatus) genotypes
    (2022) Kamaşak, Solmaz; Coşkun, Ömer Faruk; Şekerci, Akife Dalda; Gülşen, Osman
    Conservation of genetic resources is essential for the continuation of future crop production. Watermelon (Citrul-lus lanatus), a member of Cucurbitaceae, is widely distributed in tropical and subtropical regions. The aim of this study was to reveal the genetic relationships with the help of microsatellite markers in a watermelon collection free of unnecessary repetitions, and to determine the success of SSR (Simple Sequence Repeats) primers developed in cucurbits. In this study, 96 watermelon genotypes with good agronomic characteristics were used among the geno types collected from different regions of Turkey and purified up to the S4-S6 (self-pollination) stage. In the study, 33 SSR primer pairs were used to determine the genetic relationship between watermelon genotypes. In the study, a total of 67 bands were obtained with SSR primers. As a result of UPGMA (Unweighted Pair Group Method Using Arithmetic Averages) analysis, genotypes showed similarity at the level of 0.84-1.00. The number of alleles detected per primer varied between 1 and 6. In terms of the total number of alleles obtained, CMCT44 (5 units) and Cgb4767 (6 units) loci produced the most alleles. Primers with high polymorphism rate and allele excess were determined, and the possibilities for use in genetic stability analyses, variety differentiation and other genetic analyses were determined.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Moleküler markörler kullanarak çerezlik kabaklarda (Cucurbita pepo L.) saflık düzeylerinin tahmin edilmesi
    (2021) Aslan, Neslihan; Coşkun, Ömer Faruk; Şekerci, Akife Dalda; Gülşen, Osman
    Amaç: Bu çalışmada moleküler markörler kullanılarak çerezlik kabaklarda (Cucurbita pepo L.) saflık düzeylerinin tahmin edilmesi amaçlanmıştır.Yöntem ve Bulgular: Dominant ve kodominant moleküler markör teknikleri (simple sequence repeats, SSR ve inter-simple sequence repeats, ISSR) yardımıyla S0 (hiç kendileme yapılmamış), S1, S2 ve S3 kademesindeki kabakların saflık düzeyleri ile heterozigotluk arasındaki ilişki tahmin edilmiştir. SSR analizleri sonucunda CMTp182 ve CMTm66 primerlerinde ortalama PIC değeri (0.9) ve gen çeşitliliği (0.10) belirlenmiştir. ISSR analizleri sonucunda HVH(CA)7T, HVH(TCC)7 ve BDB(CA)7C primerlerinde en yüksek ortalama PIC değeri (0.4) bulunmuş olup gen çeşitliliği sırasıyla 0.61, 0.67 ve 0.86 olarak tespit edilmiştir. Bu çalışmada kullanılan markör verimliliğinin bir ifadesi olan PIC değerleri karşılaştırıldığında SSR primerlerinin ortalama PIC değeri 0.57 bulunurken, ISSR markörlerinin ortalama PIC değeri ise 0.2 olarak hesaplanmıştır. Saflaşma çalışmalarında SSR primerlerinin yüksek polimorfizm göstermeleri nedeniyle daha etkin olduğu saptanmıştır.Genel Yorum: Yapılan analizler sonucunda farklı kademeler (S0, S1, S2 ve S3) arasında heterozigot bant sayısı giderek azalan bir eğilim göstermiştir. En fazla heterozigot bant sayısı S0 kademesinden ve en az heterozigot bant sayısı S3 kademesinden elde edilmiştir. Bu durum saflaşma oranı arttıkça heterozigot bant sayısının azaldığını göstermektedir. Başarılı bulunulan primerlerin saflık düzeyi belirleme çalışmalarında kullanılabileceği sonucuna varılmıştır.Çalışmanın Önemi ve Etkisi: Bitkilerde saf hatların elde edilmesi ıslah çalışmaları için çok önemli bir etkendir. Çerezlik kabakta hibrit tohum üretiminde saf ebeveynlerin kullanılması önemlidir ve bitkilerde saflık düzeylerini tahmin etmenin pratik bir yolu bulunmamaktadır. Arazide tohumlardan elde edilen bitkiler arasındaki morfolojik özellikleri dikkate alarak genetik açılım olup olmadığı anlaşılabilmektedir. Moleküler markörlerin ebeveynlerin saflık düzeylerinin belirlenmesinde kullanılabilirliğinin belirlenmiş olması önemlidir.