Yazar "Alptekin, Davut" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 4 / 4
  • [ N/A ]
    Öğe
    The effects of daylight exposure on melatonin levels, Kiss1 expression, and melanoma formation in mice
    (Medicinska Naklada, 2020) Pazarci, Percin; Kaplan, Halil; Alptekin, Davut; Yilmaz, Mehmet; Luleyap, Umit; Singirik, Ergin; Pelit, Aykut
    Aim To determine how daylight exposure in mice affects melatonin protein expression in blood and Kiss1 gene expression in the hypothalamus. The second aim was to as sess the relationship between skin cancer formation, day-light exposure, melatonin blood level, and kisspeptin gene expression level. Methods New-born mice (n = 96) were assigned into the blind group or daylight group. The blind group was raised in the dark and the daylight group was raised under 12 hours light/12 hours dark cycle for 17 weeks. At the end of the 11th week, melanoma cell line was inoculated to mice, and t timor growth was observed for 6 weeks. At the end of the experiment, melatonin level was measured from blood serum a rid Kiss1 expression from the hypothalamus. Results The blind group had significantly higher meta tonin and lower Kiss1 expression levels than the daylight group. Tumor volume was inversely proportional to melatonin levels and directly proportional to Kiss1 expression levels. Tumor growth speed was lower in the blind than in the daylight group. Conclusion Melatonin and Kiss1 were shown to be nvolved in tumor suppression. They were affected by daylight and were mutually affected by each other.
  • [ N/A ]
    Öğe
    The first report described as an important study: The association of mannose-binding lectin gene 2 polymorphisms in children with down syndrome
    (2011) Demirhan, Osman; Tastemir, Deniz; Günesacar, Ramazan; Güzel, Ali; Alptekin, Davut
    Background: Mannose-binding lectin gene 2 (MBL2) plays a very important role in the first line of host immune response in Down syndrome (DS). The importance of MBL2 gene polymorphisms in children with DS is unclear, and no research has addressed MBL2 gene polymorphisms in patients with DS. This is the first report describing an important association between MBL2 gene polymorphisms and infections in children with DS. Materials and Methods: We compared the frequency of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) at two codons of the MBL2 gene in a cross sectional cohort of 166 children with DS and 229 controls. Polymorphisms at codons 54 (GGCGAC) and 57 (GGAGAA) in exon 1 of the MBL2 gene were typed by polymerase chain reaction (PCR)-restriction fragment length polymorphism (RFLP) technique using the restriction enzymes BshN1 (derivated from Bacillus sphaericus) and MboII (derivated from Moraxella bovis), respectively. Results: MBL2 codon 54 GA genotype frequency was found to be lower in patients with DS (22.9%) than those of healthy controls (35.8%), differences were statistically significant (OR = 0.532, 95% CI = 0.339-0.836, P = 0.008). On the other hand, codon 57 polymorphism in the MBL2 gene was detected in none of the DS patients, but only one person in the control group showed codon 57 GA genotype (OR = 1.004, 95% CI = 0.996-1.013, P = 1.000). Conclusion : Our data provides an evidence for the first time that a homozygote or heterozygote for the variant, MBL2 alleles, is not associated with infections in patients with DS, and do not influence the incidence of infections.
  • Küçük Resim
    Öğe
    İnsan metilentetrahidrofolat redüktaz enziminin kristal yapısı için bir model
    (2015) İzmirli, Müzeyyen; Akdemir, Atilla; Göğebakan, Bülent; Alptekin, Davut
    Amaç: Ökaryotik metilentetrahidrofolat redüktaz enzimi (MTHFR) olarak bilinen ve total olarak 656 aminoasitten oluşan bu enzim homodimer yapıdadır. Her ünitesi katalitik ve düzenleyici bölgelerden oluşmaktadır. MTHFR enzminin katalitik olarak aktivite gösterebilmesi için flavin-adenin dinükleotid (FAD)'in MTHFR'ye nonkovalent olarak bağlanması gerekmektedir. İnsan MTHFR enziminin geni kromozom 1p36.3'te lokalizedir. Genin dördüncü ekzonunda yerleşmiş olan MTHFR 677 C>T polimorfizmi, proteinin 222. kodonundaki alaninin valine (Ala222Val) dönüşümüne neden olmaktadır. İnsan MTHFR proteini için, proteinin kristal yapısının ortaya koyulması ile ilgili bir çalışma olmaması nedeniyle, bu çalışma ile MTHFR proteininin kristal yapısı hakkında bir model oluşturmayı amaçladık. Ayrıca MTHFR677 C>T polimorfizmi neticesinde ortaya çıkan Ala222Val değişikliğinin insan MTHFR enziminin kristal yapısında oluşturduğu değişiklikleri ortaya koymayı hedefledik. Metod: Bu amaçla, moleküler modelleme teknikleri olarak MOE bilgisayar programı (versiyon 2013.0801, Chemical Computing Group Inc., Montreal, Kanada) kullandık. Bulgular: İnsandaki MTHFR enzimi ile FAD arasındaki bağların Tyr50, Gly108, Asp109, Tyr149, Arg107, Ala127, Lys169 Tyr126, His153 ve His165 aminoasitleri üzerinden olduğunu, Tyr126 ve His165 arasındaki çift bağın FAD'ı sıkıştırma özelliği olabileceğini gördük. Sonuç: Sonuç olarak, insan MTHFR enziminin kristal yapısı hakkında bir model ortaya koyuldu ve Ala222Val değişikliğinin FAD bağlanma durumunu etkilemesi yüzünden, enzim aktivitesine etki ettiği tespit edildi
  • Küçük Resim
    Öğe
    MTHFR 677 C>T Polimorfizmi ile ilintili olduğu düşünülen hastalıklara dair Türk populasyonundaki çalışmalar
    (2014) İzmirli, Müzeyyen; Aldemir, Özgür; Göğebakan, Bülent; Alptekin, Davut
    5,10-Metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR) folik asit metabolizması için en önemli enzimlerden biridir. Bu proteinin geni 1 numaralı kromozomun kısa kolunda (1p36.3) haritalanmıştır. MTHFR enzimi, folik asit, nükleotid sentezi (DNA, RNA) gibi pek çok reaksiyonu içeren hücre metabolizmasında, kilit rol oynar. Polimorfizmler etnik kö- kene ve ırklara göre farklılık gösteren ve biyoçeşitlilikte rol oynayan bir faktördür. MTHFR 677 C>T polimorfizmi enzim aktivitesini azaltan bir polimorfizmdir. Çalışmanın amacı, Türkiye’de MTHFR C677T polimorfizmi ile ilgili olan çalışmaları derlemektir. Bu nedenle, Türkiye’de yapılmış MTHFR 677 C>T polimorfizmi ile ilgili PUBMED, Türk Biyokimya ve Klinik & Deneysel Araştırmalar dergisinde yayınlanmış bütün çalışmalar derlenmiştir. Araştırma yapılırken “MTHFR”, “Türk popülasyonu: Turkish population”, “677 C>T” “polimorfizm: polymorphism” anahtar kelimeleri kullanılmıştır. Bu çalışmalar, belli başlı hastalık gruplarına göre sınıflandırılmış ve tablolar halinde okuyucunun değerlendirmesine sunulmuştur.