Yazar "Karan, Serpil" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 2 / 2
  • Küçük Resim
    Öğe
    Heavy metal bioaccumulation, oxidative stress and genotoxicity in African catfishClarias gariepinusfrom Orontes river
    (Springer, 2020) Turan, Funda; Eken, Meltem; Ozyilmaz, Gul; Karan, Serpil; Uluca, Haluk
    One of the major problems affecting the ecosystem health is the exposure of heavy metals due to anthropogenic activities. These exposures may induce toxiogenetic damage and carcinogenesis in aquatic organism. DNA damage biomarkers for fish species detect genotoxic parameters for ecological risk assessment. In the present study, the effect of heavy metals (Cr, Cd, Cu, Fe and Mn) on DNA damage and oxidative stress ofClarias gariepinuswas examined by Comet assay at Reference site and two different sampling sites of the Orontes River. Moreover, the relationship between DNA damage and physiological response to oxidative stress caused inC. gariepinuswas investigated by sampling seasonal water and fish samples for one year. In this study, Cr, Cd and Cu in water column of Orontes River and the concentrations of Fe and Mn in liver tissue ofC. gariepinuswere highly exceed the maximum permissible limit set by EPA (1999,2016) WHO (1989) and TEG (2012) that can cause adverse effects on environment health. SOD activities in liver tissues were significantly higher than those in muscle tissues. SOD, CAT activity and MDA levels of both Site 1 and Site 2 at Orontes River were higher than those of the Reference site. In result of the COMET analysis, the highest levels of DNA damage were found at gill and liver tissues in Site 2 (17.746 +/- 1.072% T-DNA; 16.014 +/- 0.710% T-DNA respectively) at Orontes river. A higher level of DNA damage in gill cells compared to liver cells was observed in all regions of the Orontes River. In Principal component analysis (PCA), the heavy metals Cd, Cr and Cu (in the water column) and MDA in liver and muscle revealed strong contribution to the observed DNA damage that were scattered opposite to each other's along the principal components. Moreover, correlations between parameters revealed a positive significant relationship between Cd, Cr and Cu in water and DNA damage levels inC. gariepinus. Pearson correlation analysis detected a positive relationship between MDA, CAT and SOD and DNA damage levels in African catfish. Consequently, this study exposed genotoxic damage and oxidative stress ofC. gariepinusdue to metal pollution in Orontes River and lead to the better understanding of genotoxicty, oxidative stress and heavy metal relationships.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Kalkan (Scophthalmus maeoticus Pallas, 1811) populasyonlarının moleküler genetik ve fenotipik tekniklerle analizi
    (Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi, 2015) Karan, Serpil; Turan, Cemal
    Bu çalışmada kalkan Scophtalmus maeoticus'un dağılım alanını oluşturan Marmara ve Karadeniz populasyonlarının genetik ve fenotipik olarak incelenmesi amaçlanmıştır. Genetik analizler için nükleer DNA'ya bağlı mikrosatelite ve mitokondriyal DNA dizileme tekniği, fenotipik analizler için morfometrik ve meristik karakterler, otolit şekli ve otolit kimyası analizleri kullanılmıştır. Mikrosatelite analizler için beş mikrosatelit lokusu kullanılmış ve tüm populasyonlarda ortalama alel sayısı 14.4 olarak bulunmuştur. S. maeoticus populasyonlarındaki ortalama gözlenen heterozigotluk değeri ise 0.42 olarak bulunmuştur. Populasyonların FST değerlerinin ikişerli karşılaştırılması sonucunda tüm populasyonlar arasında istatistiksel olarak önemli derecede farklılık bulunmuş olup (P<0,001), en küçük genetik uzaklık (0.19549) Marmara Denizi ve Batı Karadeniz populasyonları arasında görülürken en büyük uzaklık (0.21755) ise Marmara Denizi ve Doğu Karadeniz populasyonları arasında görülmüştür. Populasyonlar içi genetik çeşitlilik ise en düşük Doğu Karadeniz populasyonunun (0.716082), en yüksek genetik çeşitlilik (0.748735) ise Batı Karadeniz populasyonunun olmuştur. Mitokondriyal DNA dizi analizi sonucunda kullanılan 566 bç COI gen bölgesinin 10 bç'lik kısmı değişen bölge olup, 1 bç'lik bölge ise populasyonlar arasında parsimoni anlamlı bölge görevi görmüştür. Nükleotid kompozisyonu A= % 23.2, T =% 28.8, C= % 28.4, G= % 19.6 olarak belirlenmiştir. Tüm populasyonlar arasındaki ortalama genetik ve haplotipik çeşitlilik değerleri sırasıyla 0.00148 ve 0.6345 olarak bulunmuştur. Populasyonların genetik uzaklık değerlerinin ikişerli karşılaştırılması sonucunda sadece Marmara ve Doğu Karadeniz populasyonlar arasında istatistiksel olarak önemli derecede farklılık bulunmuş olup (P<0,001), en küçük genetik uzaklık (0.001416) Doğu ve Batı Karadeniz populasyonları arasında görülürken en büyük uzaklık (0.001593) ise Marmara Denizi ve Doğu Karadeniz populasyonları arasında görülmüştür. Morfometrik ve meristik karakterlerin kümeler arası korelasyon analizinde sadece Doğu Karadeniz populasyonu diğer populasyonlardan farklı olduğu gözlemlenmiştir. Otolit morfolojisinin kümeler arası korelasyon analizinde sadece Doğu Karadeniz populasyonun diğer populasyonlardan farklılık gösterdiği gözlemlenmiştir. Otolit kimyasında Na, Ba, Mn, Sr, Ca, Zn, Mg, Fe ve K elementleri incelenmiş ve kümeler arası korelasyon analizinde tüm populasyonların birbirlerinden farklı olduğu tespit edilmiştir.