Yazar "Çarpar, Hakan" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 4 / 4
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Detection and characterization of phytoplasmas in some cucurbits (Cucurbitaceae) and bindweed (Convolvulaceae) in Hatay Province of Turkey(2022) Çarpar, Hakan; Sertkaya, GülşenAims: During a disease survey conducted in 2019, typical symptoms including yellowing of the leaves, stunting, shortening of internodes, proliferation of auxiliary shoots (witches'-broom), the bunchy appearance of growth at the ends of stems (rosetting), virescence of flowers or sterility, phyllody, small and deformed leaves and fasciation were observed on suspected cucurbit plants growing in Hatay province. Therefore, this study was carried out to determine the phytoplasma infection(s) on cucurbit crops and bindweed in Hatay province of Turkey.Methods and Results: In total; 4 pumpkins (winter squash: Cucurbita moschata Duchesne), 12 summer squash (Cucurbita pepo L.) and 2 bindweed (Convolvulus arvensis L.) samples were collected from suspected plants in cucurbit fields in Hatay province. Some of the plants (2 pumpkins, 10 summer squash and 2 bindweeds) exhibited symptoms related to phytoplasmas. Total nucleic acid was extracted by CTAB method. PCR amplification of 16S rDNA with phytoplasma specific primer pairs; F1/R0 followed by R16F2n/R2 confirmed the phytoplasma presence. Expected size amplicons of ~1.2 kb were obtained from infected samples from symptomatic cucurbits (12/12) and bindweed (1/2), but not from asymptomatic cucurbit plants (0/4). The sequences of the 4 symptomatic samples were deposited in NCBI GenBank (MT163353, MT163393, MT163396, and MT163469).Conclusions: After sequencing and phylogenetic analyses it was revealed that the squash isolates had 99% sequence identity with “Candidatus phytoplasma trifolii” (16SrVI) and the bindweed isolate had 99% sequence identity with “Candidatus phytoplasma solani” (16SrXII).Significance and Impact of the Study: There is a lack of knowledge on the status of phytoplasma infections and natural hosts in cucurbits in Turkey. According to our knowledge, this is the first report of a member of 16SrVI group, Candidatus phytoplasma trifolii associated with phytoplasma infection in winter squash-pumpkin (C. moschata) and summer squash (C. pepo) in Turkey.Öğe Hatay ili biber (Capsicum annuum L.) üretim alanlarında fitoplazma hastalıklarının, vektörlerinin ve diğer konukçularının araştırılması(Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi, 2021) Çarpar, Hakan; Sertkaya, GülşenBu çalışma 2015-2020 yılları arasında Hatay ilinde yetiştiriciliği yapılan biber alanlarındaki fitoplazma hastalıklarının belirlenmesi amacıyla yürütülmüştür. Çalışmada fitoplazmalara özgü sarılık, yaprakların kaşık şeklini alması, phyllody, virescence (yeşillenme), çiçeklerin dumura uğraması (sterility), iri tomurcuk, çalılaşma belirtisi gösteren biber, susam, fesleğen, patlıcan, domates ve yabancı otlardan örnekler alınmıştır. Ayrıca vektör böceklerin belirlenmesi amacıyla D-VAC ile böcek toplanmıştır. Bölgede yetiştiriciliği en çok yapılan salçalık biberlerde belirtiler %0,5-3 oranında gözlenir iken süs biberi ve Samandağ biberinde fitoplazma belirtilerine hiç rastlanmamıştır. Arazi içerisindeki susam ve fesleğen bitkilerinde bu oran %30 olarak tespit edilmiştir. Biber arazilerinde en çok Empoasca sp., Cicadulina bipunctata ve Psammotettix sp., türleri bulunurken bunları Exitianus capicola, Euscelidius sp., Anaceratagallia laevis ve Balchutha hebe türleri takip etmiştir. Kontrollü koşullarda yapılan T göz ve yonga aşı denemeleri ile hastalıklı bitkilerden sağlıklı test bitkilerine taşıma çalışmalarında susam ve fesleğen örneklerinden Cezayir menekşesine yapılan aşılamalarda başarılı olunmuştur. Tüm bitki örneklerinin toplam nükleik asit izolasyonları CTAB yöntemine göre yapılmış, böcek örneklerinde ise MN marka hazır kitlere göre yapılmıştır. Bitki örneklerinde fitoplazma tespitinde DAPI DNA boyamı yöntemi de kullanılmış ve fitoplazma varlığı tespit edilmiştir. Yapılan çalışmalar sonucunda biber (Capsicum annuum), domates (Solanum lycopersicum), fesleğen (Ocimum basilicum), susam (Sesamum indicum) ve tarla sarmaşığı (Convolvulus arvensis) bitkilerinde ve de bazı böcek türlerinde fitoplazmalar belirlenmiştir. Pozitif bulunan örnekler sekanslanmış ve MEGA X programında değerlendirilerek Genbankası'na sonuçlar yüklenmiştir. Genbankası'na yüklenen biber (MT993358), susam (MT994434), domates (MT992754), fesleğen (MT994432), Empoasca sp. (MT994430), Exitianus capicola (MT994433), Euscelidius sp. (MT994431) türlerinde Candidatus Phytoplasma trifolii; tarla sarmaşığı (MT993422) ve domates (MT992796) türlerinde Candidatus Phytoplasma solani tespit edilmiştir. Ayrıca biber örneklerinden fitoplazma tespit edilen 2 örnekte ELISA yöntemi ile cucumber mosaic virus (CMV) karışık enfeksiyon olarak bulunmuştur. Mevcut literatür bilgilere göre Ca. Phytoplasma trifolii, susam, fesleğen, Exitianus capicola ve Euscelidius sp.'de ilk kez bu çalışma ile tespit edilmiş ve Genbankası'na yüklenmiştir.Öğe Hatay ili patates üretim alanlarında yonca mozaik virüsü (Alfalfa Mosaic Virus: AMV)’nün araştırılması(2017) Sertkaya, Gülşen; Çarpar, Hakan; Sertkaya, ErdalHatay ili patates alanlarında 2009 ve 2010 yıllarında yapılan çalışmalarda Yonca mozaik virüsü (Alfalfa mosaic virus: AMV) ile enfekteli olabileceğinden şüphelenilen simptomlu patates bitkileri belirlenmiştir. Patates alanlarında AMV'nin varlığı ve yaygınlığı ile diğer konukçularını belirlemek üzere 2014-2015 yıllarında farklı çeşitlere ait patates tarlalarından şüpheli bitki örnekleri alınmıştır. İncelenen patates tarlalarında özellikle yabancı otlar üzerinde yoğun olarak AMV potansiyel vektörü olan Aphis fabae Scopoli, A. gossypii Glover, A. solanella Theobald, Myzus persicae (Sulzer), Macrosiphum euphorbiae (Thomas) ve Rhopalosiphum padi L. türleri belirlenmiştir. Sarı desenler, lekeler ve daha sonra şiddetli kloroz gösteren patates yaprak örneği serolojik (DAS ELISA: Double antibody sandwich-Enzyme linked immunosorbent assay) ve biyolojik indeksleme (mekanik inokulasyon) yöntemleri ile incelenmiştir. Ülkemizde Hatay ilinde yetiştirilen patateste son birkaç yıldır AMV'nin enfeksiyon oluşturduğu belirlenmiştir. Yabancı ot türlerinden Physalis angulata örneklerinde 2014 yılında %15.3 oranında AMV enfeksiyonu belirlenmiştir. Simptomlu patates bitkilerinde AMV enfeksiyonu 2014 ve 2015 üretim dönemlerinde %5.4 ve %4.6 olarak bulunmuştur. AMV'nin patateste düşük seviyelerde enfeksiyon oluşturmasına rağmen, özellikle Amik Ovası'nda yetiştirilen yonca, domates ve biber gibi diğer kültür bitkileri ile yabacı otlar veya bu kaynaklardan patatese virüsün vektör yaprak bitleri ile taşınabilmesi nedeni ile Hatay ilinde patateste AMV enfeksiyonu belirlenmesi önem taşımaktadır. Hatay ilinde patates bitkilerinde son birkaç yıldır görülmeye başlayan AMV enfeksiyonu için il dışından gelen enfekteli tohumluk yumruların kaynak olduğu düşünülmektedir. AMV'nin yıllara içinde patates alanlarındaki durumunu izlemek için patates, yabancı otlar ve diğer konukçuları ile ilgili çalışmalar devam etmektedirÖğe Hatay ili patates üretiminde önemli bazı fitopatolojik sorunların belirlenmesi(Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi, 2014) Çarpar, Hakan; Sertkaya, GülşenHatay ili patates üretim alanlarında 2013- 2014 yıllarında patates, yabancı ot ve böcek örnekleri toplanmıştır. Bitki örneklerinde önemli fitopatolojik etmenler araştırılmıştır. Yaygın virüslerden AMV, CMV, PLRV, PVX, PVY (PVY-N ve PVY-C) ve TRV; fitoplazma hastalıkları ile bakteriyel ve fungal patojenlerin varlığı araştırılmıştır. Virüsler simptom gözlemleri, seroloji (DAS-ELISA), taşıma çalışmaları (doku aşılaması ve tohumla taşıma), iklim odasında mekanik inokulasyon çalışmalarıyla incelenmiştir. Fitoplazmalar simptomoloji, DAPI (floresan mikroskopi) ve moleküler (PCR) yöntemler ile fungal ve bakteriyel patojenler simptomoloji, kültüre alma, patojenite testleri (pektolitik aktivite değerlendirmesi) ve yağ asiti metil ester (FAME) yöntemleriyle araştırılmıştır. Potansiyel virüs ve fitoplazma vektörleri ile doğal düşmanlar belirlenmiştir. Arazi çalışmalarında hasat döneminde enfeksiyon oranlarının arttığı bitkilerde yapraklarda sarı mozaik lekelenmeler, yapraklarda ve özellikle tepe sürgünlerde şiddetli kloroz, damar nekrozu, tepe ve gövde morarması, havai yumru oluşumları, koltuk sürgünlerinde şişkinlikler, aşırı sürgün oluşumu, boğum aralarında kısalma, yaprakların küçülmesi ve rulo şeklinde yukarı doğru kıvrılması, tepe sürgünlerinde beyazlaşmaya yakın şiddetli kloroz, erken yaşlanma, yumrularda küçülme, yaprak yanıklıkları ve külleme gibi belirtiler gözlenmiştir. Tohumluk yumru etinde %1 oranında nekrotik dokular gözlenmiştir. Patates örneklerinde en fazla PVY enfeksiyonu belirlenmiştir (%49.5). PLRV ve AMV enfeksiyonu %5.4 oranında bulunmuştur. Çoklu enfeksiyon olarak düşük oranda PVY+PLRV bulunmuştur (%1.6). Mevcut bilgilerimize göre ülkemizde patates örneklerinde ilk kez AMV enfeksiyonu belirlenmiş, CMV, PVX ve TRV belirlenmemiştir. PVY ile enfekteli olduğu belirlenen bitkilerden tesadüfi seçilen 58 örneğin 35'inde PVY-N belirlenmiştir (%60.3). PVY-C belirlenmemiştir. Cuscuta sp., Solanum nigrum, Convolvulus arvensis gibi yabancı ot türlerinin oldukça yaygın olduğu gözlenmiştir. Özellikle Cuscuta sp. bitki ölümlerine ve virüs ve fitoplazma gibi hastalıklarının yayılmasına neden olduğu belirlenmiştir. Orobanche ramosa Hatay'da patates alanlarında ilk kez gözlenmiştir. Catharanthus roseus test bitkilerine doğal fitoplazma taşıma çalışması yapılmıştır. Physalis angulata, Solanum nigrum ve Cuscuta sp. örneklerinde sırası ile %53.8 (7/13), %100 (2/2), %46.2 (6/13) oranında PVY enfeksiyonu belirlenmiştir. PCR ve DAPI yöntemleri ile patates bitkilerinde fitoplazma enfeksiyonları belirlenmiştir. Yaygın olarak bakteriyel etmenlerden Erwinia carotovora, fungal etmenlerden Alternaria solani ve Phtophthora infestans gibi patojenler belirlenmiştir. Potansiyel vektör olarak afit (Myzus persicea), cicadellidae (Circulifer haematoceps, Macrosteles spp., Cicadulina bipunctella, Zyginidia pullula, Psammotettix spp., Exitianus capicola) ve cixiid (Hyalesthes obselatus Signoret) türleri toplanmıştır.
