Ekinokokkozis’te germinal membran ve kist sıvısının raman spektroskopisi ile moleküler düzeyde biyokimyasal analizi

Basit Öğe Kaydı
dc.authoridhttps://orcid.org/0000-0003-3411-2935en_US
dc.authoridhttps://orcid.org/0000-0001-9118-3153en_US
dc.authoridhttps://orcid.org/0000-0002-0229-2911en_US
dc.authoridhttps://orcid.org/0000-0003-0973-6893en_US
dc.authoridhttps://orcid.org/0000-0001-5527-3741en_US
dc.authoridhttps://orcid.org/0000-0002-7810-3785en_US
dc.authoridhttps://orcid.org/0000-0002-2501-0083en_US
dc.contributor.authorHamamcı, Berna
dc.contributor.authorAçıkgöz, Güneş
dc.contributor.authorKılıç, Erol
dc.contributor.authorKaraaslan, Kerem
dc.contributor.authorÇetinkaya, Ülfet
dc.contributor.authorDurgun Yetim, Tülin
dc.contributor.authorYetim, İbrahim
dc.date.accessioned2020-07-23T08:01:01Z
dc.date.available2020-07-23T08:01:01Z
dc.date.issued2019en_US
dc.departmentHatay Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokuluen_US
dc.description.abstractAmaç: Hydatidosis, Echinococcus granulosus’un larva evresinin neden olduğu zoonotik paraziter bir enfeksiyondur. Çalışmada, karaciğer tutulumu olan hastaların cerrahi sırasında elde edilen germinal membran ve kist sıvılarının Raman spektroskopisi ile moleküler düzeyde biyokimyasal yapılarının incelenmesi amaçlanmıştır. Yöntemler: Çalışmada, germinal membran ve kist sıvılarının mitokondriyal gen bölgesine göre moleküler karakterizasyonları belirlenmiş ve filogenetik analizleri yapılmıştır. Örneklerde Raman spektroskopisi kullanılarak 300-1800 cm-1 arasındaki spektral bantlar incelenmiştir. Bulgular: PZR analizleri sonucunda hastalardan elde edilen germinal membranlarda ve kist sıvılarında yaklaşık 400 bç büyüklüğünde DNA bandı elde edilmiştir. Germinal membranda 780, 880, 970, 1151, 1200, 1270 cm-1’de, kist sıvısında 780 ve 1200 cm-1’de farklı pikler gözlenmiştir. 1333-1335 cm-1’de elde edilen en şiddetli spektral bantların CH3CH2 kollajen ve polinükleotit zincirini gösteren modlar olduğu belirlenmiştir. Bu ise, E. granulosus’un moleküler düzeyde biyokimyasal yapısını gösteren spesifik pik olarak değerlendirilmiştir. Sonuç: Mikroorganizmaların tanımlanmasında ve biyolojik dokuların biyokimyasal analizlerinde; moleküler, serolojik ve konvansiyonel farklı tanı yöntemleri kullanılmaktadır. Bu yöntemlere ek olarak Raman spektroskopisinin hızlı, tahribatsız ve noninvaziv bir yöntem olduğu yapılan çalışmada gösterilmiştir. Dolayısıyla mikroorganizmaların temel biyokimyasal bileşenlerinin moleküler düzeyde analiz edilebilmesi bakımından alternatif bir yöntem olacağı düşünülmektedir.en_US
dc.description.abstractObjective: Hydatidosis is a zoonotic parasitic infection caused by the larval stage of Echinococcus granulosus. The aim of this study was to investigate the biochemical structures of germinal membrane and cyst fluids obtained from patients with liver involvement during surgery, by Raman spectroscopy at the molecular level. Methods: Molecular characterization of germinal membrane and cyst fluid according to mitochondrial gene region was determined and phylogenetic analysis was performed. Raman spectroscopy was used in samples and spectral bands between 300 and 1800 cm-1 were examined. Results: As a result of PCR, approximately 400 bp DNA band was obtained from germinal membranes and cyst fluids gathered from patients. Peaks were observed at 780, 880, 970, 1151, 1200, 1270 cm-1 for germinal membrane and at 780 and 1200 cm-1 for cyst fluid. The highest spectral bands were obtained at 1333-1335 cm-1 and were determined to be modes indicating the CH3CH2 collagen and polynucleotide chain. Conclusion: In the identification of microorganisms and biochemical analysis of biological tissues; different diagnostic methods such as molecular, serological and conventional methods are used. In addition to these methods, Raman spectroscopy has been shown in studies to be a fast, non-destructive and noninvasive method. Therefore, it is thought to be an alternative method for analyzing the basic biochemical components of microorganisms at molecular level.en_US
dc.identifier.citationHamamcı, B., Açıkgöz, G., Kılıç, E., Karaaslan, K., Çetinkaya, Ü., Yetim, T. D., & Yetim, İ. (2019). Ekinokokkozis’ te Germinal Membran ve Kist Sıvısının Raman Spektroskopisi ile Moleküler Düzeyde Biyokimyasal Analizi. Türkiye Parazitolojii Dergisi, 43(4), 175.en_US
dc.identifier.doi10.4274/tpd.galenos.2019.6293en_US
dc.identifier.endpage181en_US
dc.identifier.issn1300-6320
dc.identifier.issue4en_US
dc.identifier.pmid31865652en_US
dc.identifier.scopus2-s2.0-85077264054en_US
dc.identifier.scopusqualityQ3en_US
dc.identifier.startpage175en_US
dc.identifier.trdizinid339829en_US
dc.identifier.urihttps://dx.doi.org/10.4274/tpd.galenos.2019.6293
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12483/2917
dc.identifier.volume43en_US
dc.indekslendigikaynakScopusen_US
dc.indekslendigikaynakPubMeden_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.language.isotren_US
dc.publisherTürkiye Parazitoloji Derneğien_US
dc.relation.ispartofTürkiye Parazitoloji Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectEchinococcus granulosusen_US
dc.subjectRaman spektroskopisien_US
dc.subjectBiyokimyasal analizen_US
dc.subjectEchinococcus granulosusen_US
dc.subjectRaman spectroscopyen_US
dc.subjectBiochemical analysisen_US
dc.titleEkinokokkozis’te germinal membran ve kist sıvısının raman spektroskopisi ile moleküler düzeyde biyokimyasal analizien_US
dc.title.alternativeBiochemical snalysis of germinal membrane and cyst fluid by raman sSpectroscopy in echinococcosisen_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Hamamci,Berna2019.pdf
Boyut:
669.18 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
[ N/A ]
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
PubMed İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu