Türkiye denizlerinde bulunan sübye (Sepia officinalis L. 1758) popülasyonlarının genetik analizi

dc.contributor.advisorTuran, Cemal
dc.contributor.authorYağlıoğlu, Deniz
dc.date.accessioned2024-05-28T11:15:31Z
dc.date.available2024-05-28T11:15:31Z
dc.date.issued2007en_US
dc.departmentEnstitüler, Fen Bilimleri Enstitüsü, Su Ürünleri Ana Bilim Dalıen_US
dc.description.abstractBu çalısmada, Türkiye Denizleri'nde bulunan Sübye (Sepia officinalis) populasyonlarının genetik yapısı mtDNA PCR-RFLP yöntemi kullanılarak analiz edilmistir. Çalısmada kullanılan örnekler Akdeniz'den (skenderun Körfezi ve Antalya), Ege Denizi'nden (zmir Körfezi) ve Marmara Denizi'nden avlanmıstır. MtDNA'nın ND 5/6 geni PCR yöntemi ile çogaltılarak altı sınırlama enzimi (BsurI, AluI, Bsh1236I, Hin6I, RsaI, XhoI) ile kesilmistir. RFLP sonucunda 120 sübye bireyinde toplam 7 haplotip saptanmıstır. Populasyonlar arasında herhangi bir haplotip paylasımı bulunmadıgı görülmüstür. Haplotiplerin evrimsel uzaklık degerlerine bakıldıgında, en fazla uzaklıgın (0.029684) Antalya Körfezi populasyonunun iki bireyinde tespit edilen ABCBBA genotipiyle, Marmara Denizi populasyonunun 25 bireyinde tespit edilen BAAACA genotipi arasında oldugu tespit edilmistir. Populasyonlar içi ortalama haplotip çesitliligi 0.1075, nükleotid çesitliligi 0.000818 olarak bulunmustur. Populasyonlar arası ortalama nükleotid çesitliligi 0.010208, ortalama nükleotid farklılıgı ise 0.009390 olarak bulunmustur. Populasyonlar arası genetik uzaklık degerlerine bakıldıgında, en yüksek degerin skenderun Körfezi Populasyonu ile Marmara Denizi Populasyonu arasında (0.015279), en düsük degerin ise, Ege Denizi Populasyonu ile Antalya Körfezi Populasyonu (0.003786) arasında oldugu görülmektedir. Monte-Carlo (X2) kili Karsılastırma Analizi sonucu bütün populasyonlar arasında önemli derecede genetik farklılıklar oldugu belirlenmistir (P<0.001). UPGMA soy agacında Antalya ve Ege populasyonlarının birbirlerine en yakın taksonomik iliskiyi gösterdigi ve skenderun Körfezi Populasyonu'nun da bu populasyonlara en uzak taksonomik iliskiyi gösterdigi tespit edilmistir. 2007, 48 sayfaen_US
dc.description.abstractIn this study, the genetic structure of common cuttlefish (Sepia officinalis) populations from Turkish Seas were analysed with mtDNA PCR-RFLP method. Samples were catched from Mediterraean Sea, (Iskenderun Bay and Antalya) Aegean Sea (Izmir Bay) and Marmara Sea. The complete NADH 5/6 gene of mtDNA amplified by PCR were digested with six restriction enzymes, BsurI, AluI, Bsh1236I, Hin6I, RsaI, XhoI. As a result, a total of seven haplotypes were detected from 120 individuals. No haplotype sharing was observed among populations. The highest evolutionary distance was observed between the ABCBBA and BAAACA haplotypes detected in the Antalya Bay and Marmara Sea populations respectively. The average haplotype diversity and nucleotid diversity within populations were 0.1075 and 0,000818 respectively. The average nucleotid diversity and nucleotide divergence between populations were 0.010208 and 0.009390 respectively. The highest genetic divergence was observed between Iskenderun Bay and Marmara Sea Populations (0.015279), and the lowest genetic divergence was observed between Aegean Sea and Antalya Bay populations (0.003786). In Monte Carlo (X2) pairwise comparisons highly significant differences between all populations (P<0.001) were observed. In UPGMA dendrogram, Antalya and Aegean samples clustered as a closest taxa and Iskenderun Bay samples clustered as most divergent taxa. 2007, 48 pagesen_US
dc.identifier.endpage57en_US
dc.identifier.startpage1en_US
dc.identifier.urihttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=ePX_SaJ0b35Gq45swKG3lMEWOfpx3go2uAJTcvB2z9XoLlGquX3uwZzLpj_KcF-B
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12483/5405
dc.identifier.yoktezid202781en_US
dc.language.isoturen_US
dc.publisherHatay Mustafa Kemal Üniversitesien_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectSu Ürünlerien_US
dc.subjectAquatic Productsen_US
dc.subjectTürkiye denizlerien_US
dc.subjectsübyeen_US
dc.subjectpopulasyon genetigien_US
dc.subjectMtDNAen_US
dc.subjectND 5/6 genien_US
dc.subjectPCR-RFLP,en_US
dc.subjectTurkish seasen_US
dc.subjectcommon cuttlefishen_US
dc.subjectpopulation geneticsen_US
dc.subjectMtDNAen_US
dc.subjectND 5/6 geneen_US
dc.subjectPCR-RFLP.en_US
dc.titleTürkiye denizlerinde bulunan sübye (Sepia officinalis L. 1758) popülasyonlarının genetik analizien_US
dc.title.alternativeGenetic analyse of the common cuttlefish (Sepia officinalis L. 1758) populations on the Turkish seasen_US
dc.typeMaster Thesisen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Yükleniyor...
Küçük Resim
İsim:
202781.pdf
Boyut:
3.5 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text