Kafes kuşlarında genişlemiş spektrumlu beta laktamaz sentezleyen Esherichia coli varlığının araştırılması

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorYılmaz, Ebru Şebnem
dc.contributor.authorDolar, Ayşe
dc.date.accessioned2024-05-28T11:23:32Z
dc.date.available2024-05-28T11:23:32Z
dc.date.issued2015en_US
dc.departmentEnstitüler, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Ana Bilim Dalıen_US
dc.description.abstractGenişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) sentezleyen Escherichia coli izolatlarının veya Enterobactericeae üyelerinin prevelansındaki artış, Türkiye dahil olmak üzere tüm dünyada yaygın olarak bulunmakta ve gittikçe büyüyen bir sorun olarak karşımıza çıkmaktadır. Bu tez çalışmasında, Hatay ilinde kafes kuşu yetiştiriciliği yapan petshop'lardan alınan farklı kuş türlerine ait gaita örneklerinde GSBL sentezleyen E. coli varlığının belirlenmesi amaçlandı. Gaita örnekleri 2 µg/ml sefotaksim içeren Eosine Methylene Blue (EMB) agara ekildi. Fenotipik doğrulama testleriyle konfirme edilen pozitif izolatların GSBL tipi Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ve DNA dizi analizi ile araştırıldı. GSBL üreten izolatların antimikrobiyal duyarlılıkları disk difüzyon yöntemiyle, filogenetik gruplanması ise PZR ile tespit edildi. GSBL sentezleyen E. coli gaita örneklerin % 2,7'sinden (4/150) izole edildi. GSBL sentezleyen % 2,7 E. coli suşlarında, GSBL genleri blaTEM-1b (n=4), blaCTX-M-15 (n=2), blaCTX-M-1 (n=2) olarak tespit edildi. blaOXA ve blaSHV genleri ise tespit edilmedi. İzolatların tamamı gentamisin, imipenem, sefotetan, amikasin, sefoksitin ve tobramisine duyarlı bulunurken; ampisilin (%100), amoksisilin/klavulanik asit (%100), aztreonam (%100), nalidiksik asit (%100), cephalotin (%100), siprofloksasin (%100), tetrasiklin (%100), sefepime (%50), kloramfenikol (%50), streptomisin (%50), sülfametoksazol/trimetoprim (%50) ve kanamisine (%25) ise değişen oranlarda direnç belirlendi. Filogenetik analizler sonucu GSBL pozitif izolatların tamamının B1 grubuna ait olduğu bulundu. Bu çalışma ile Türkiye'de ilk kez kafes kuşlarında fekal kaynaklı GSBL sentezleyen E. coli varlığı tespit edilmiştir. Ayrıca çalışma sonuçlarıyla, kafes kuşlarının potansiyel GSBL sentezleyen E. coli taşıyıcısı olduğu ve halk sağlığı açısından da potansiyel bir risk oluşturabileceği ortaya konmuştur.en_US
dc.description.abstractThe increase in the prevalence of Escherichia coli or other Enterobacteriaceae species which produce extended-spectrum beta-lactamases (ESBLS), have been extensively documented and have been an emerging public health problem all over the world, including Turkey. In this study, it was aimed to determine the presence of extended-spectrum beta-lactamase (ESBLs) producing E. coli, which is taken from numerious cage birds gaita samples from pet shops in the province of Hatay. Gaita samples were inoculated on to Eosine Methylene Blue (EMB) agar containing 2 µg/ml cefotaxime. The positive isolates were confirmed by phenotypic confirmatory test of ESBL types were investigated by Polymerase Chain Reaction (PCR) and DNA sequence analysis. Antimicrobial susceptibility of ESBL-producing isolates were determined by disk diffusion method, phylogenetic classification were determined by the PCR. ESBL-producing E. coli isolates achieved 2,7 % (4/150) from gaita samples. ESBL genes blaTEM-1b (n=4), blaCTX-M-15 (n=2), blaCTX-M-1 (n=2) were determined. blaOXA and blaSHV genes were not detected. All ESBL positive isolates were sensitive to gentamicin, imipenem, cefotetan, amikacin, cefoxitin and tobramycin; ampicillin (100%), amoxicillin/clavulanic acid (100%), aztreonam (100%), nalidixic acid (100%), cephalotin (100%), ciprofloxacin (100%), tetracycline (100%), cefepime (50%), chloramphenicol (50%), streptomycin (50%), sulfamethoxazole/trimethoprim (50%) and kanamycin (25%) showed resistance in varying amounts. Phylogenetic analysis result of all ESBL positive isolates were detected to belong to the B1 group. With this study, the presence of the fecal origin ESBL producing E. coli was determined in cage birds for the first time in Turkey. In addition, the study results showed that cage birds have potential ESBL E. coli carrier and potential risk for public health.en_US
dc.identifier.endpage60en_US
dc.identifier.startpage1en_US
dc.identifier.urihttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=OykDDeWBWTL9-Wm52sZBrBx1LozXkO_2jwp4AN-Bn44sk4t550w63ixBZjA1BAkP
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12483/6665
dc.identifier.yoktezid449287en_US
dc.language.isoturen_US
dc.publisherHatay Mustafa Kemal Üniversitesien_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectBiyolojien_US
dc.subjectBiology ; Genetiken_US
dc.subjectGenişlemiş spektrumlu beta-laktamazen_US
dc.subjectEscherichia colien_US
dc.subjectkafes kuşlarıen_US
dc.subjectPZRen_US
dc.subjectExtended-spectrum beta-lactamaseen_US
dc.subjectEscherichia colien_US
dc.subjectcage birdsen_US
dc.subjectPCRen_US
dc.titleKafes kuşlarında genişlemiş spektrumlu beta laktamaz sentezleyen Esherichia coli varlığının araştırılmasıen_US
dc.title.alternativeInvestigation of the presence of extended spectrum beta lactamase producing Esherichia coli in cage birdsen_US
dc.typeMaster Thesisen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
449287.pdf
Boyut:
1.39 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir

Koleksiyon

FBE Tez Koleksiyonu