Sığırlarda geniş spektrumlu beta-laktamaz sentezleyen Escherichia coli prevalansının belirlenmesi

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorAslantaş, Özkan
dc.contributor.authorElmacıoğlu, Sibel
dc.date.accessioned2024-05-28T11:17:28Z
dc.date.available2024-05-28T11:17:28Z
dc.date.issued2013en_US
dc.departmentEnstitüler, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Sağlık Bilimleri BölümüMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalıen_US
dc.description.abstractSığırlarda Geni?lemi? Spektrumlu Beta-laktamaz Sentezleyen Escherichia coli Prevalansının Belirlenmesi Bu çalı?mada, Hatay?da yetiştirilen sığırlarda geniş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) sentezleyen Escherichia coli prevalansının belirlenmesi amaçlandı. Rektal svab örneklerinden 2 mg/L sefotaksim içeren Eosine Methylene Blue (EMB) agara ekimleri yapıldı. Pozitif izolatlar fenotipik doğrulama testleri ile konfirme edildi ve GSBL tipi polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ve sekans analizi ile araştırıldı. GSBL pozitif izolatların antimikrobiyal duyarlılıkları disk difüzyon testi ile filogenetik dağılımları ise PZR ile belirlendi. GSBL sentezleyen E. coli rektal svab örneklerinin %8.3?ünden (26/312) izole edildi. İzolatlarda en yaygın GSBL genleri sırasıyla blaTEM-1b (n=21), blaCTX-M-15 (n=12), blaCTX-M-1 (n=1), blaCTX-M-3 (n=2) ve blaOXA (n=1) olarak tespit edildi. Fakat izolatlarda blaSHV geni tespit edilmedi. GSBL pozitif izolatların tamamı sefotetan ve imipeneme duyarlı bulunurken; ampisilin (%100), seftriakson (%100), sefalotin (%96.2), sefaperozon (%88.5), streptomisin (%80.8), sulfametoksazol/trimetoprim (%76.9), tetrasiklin (%73.1), kloramfenikol ve kanamisin (%50), nalidiksik asit ve amoksisilin/klavulanik asit (%46.2), aztreonam (%38.5), siprofloksasin (%34.6), gentamisin (%11.5) ve sefoksitine (%3.8) değişen oranlarda direnç saptandı. Filogenetik analizler GSBL pozitif izolatların B1 (n=1, %50), A (n=9, %34.6) ve D1 (n=1, %3.8) olmak üzere 3 grupta yer aldığını gösterdi. Bu çalışma ile Türkiye?de ilk kez sığırlarda CTX-M-15, CTX-M-11, CTX-M-3 ve OXA-1 üreten fekal E. coli taşıyıcılığı tespit edilmiştir. Ayrıca, mevcut çalışmanın sonuçları Hatay ilinde yetiştirilen gerek süt ve gerekse de besi sığırlarının GSBL sentezleyen E. coli yönünden potansiyel rezervuar olduğunu göstermektedir. Bu nedenle, GSBL sentezleyen bakteriler dahil antimikrobiyal dirençli bakteriler hayvanlarda sürekli olarak izlenmeli ve GSBL pozitif bakterilerin klonal yayılımının önlenmesi için antibiyotikler bilinçli olarak kullanılmalıdır.en_US
dc.description.abstractDetermination of the Prevalence of Extended Spectrum Beta-lactamase Producing Escherichia coli in Cattle In this study, it was aimed to determine the prevalence of extended-spectrum beta-lactamase (ESBLs) producing Escherichia coli in cattle in Hatay. Rectal swab samples were spread on the Eosin Methylen Blue (EMB) agar containing cefotaxime (2 mg/L). Isolates were confirmed using ESBL confirmatory tests. ESBL types were investigated by polymerase chain reaction (PCR) and sequencing. Antimicrobial susceptibility of the isolates was determined by disk diffussion method and distribution of phylogenetic groups was also determined by PCR. ESBL producing E. coli was isolated from 8.3% (26/312) of rectal swab samples. The most common ESBL gene was blaTEM-1b (n=21), followed by blaCTX-M-15 (n=12), blaCTX-M-1 (n=1), blaCTX-M-3 (n=2), and blaOXA (n=1). Howevwe, blaSHV gene was not detected. All ESBL positive isolates were found to be sensitive to cefotetan and imipenem, while variable rates of resistance were determined against other antimicrobials including ampicillin (100%), ceftriaxone (100%), cefalothin (96.2%), cefaperozone (88.5%), streptomycin (80.8%), trimethoprim-sulfamethoxazole (76.9%), tetracycline (73.1%), chloramphenicol and kanamycin (50%), nalidixic acid, amoxicillin/clavulanic acid (46.2%), aztreonam (38.5%), ciprofloxacin (34.6%), gentamycin (11.5%) ve cefoxitin (3.8%). Phylogenetic analysis revealed three groups being B1 (n=13, 50%), A (n=9, 34.6%), and D1 (n=4, 15.4%). For the first time, faecal carriage of CTX-M-15, CTX-M-11, CTX-M-3 and OXA-1 producing E. coli was detected in cattle in Turkey. In addition, results of the present study showed that both dairy cattle and beef cattle are potential reservoir of ESBL producing E. coli in Hatay. Therefore, continuous monitoring for antimicrobial resistant bacteria including ESBL producing bacteria in animals and prudent use of antimicrobials is necessary to prevent their clonal spread.en_US
dc.identifier.endpage55en_US
dc.identifier.startpage1en_US
dc.identifier.urihttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=iTkOhwevEenJZ3onUvs52uGsJPDRIaQcxa2aCSM_-T_qx8iSA_Akn-gDDN1KXSG5
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12483/5930
dc.identifier.yoktezid340736en_US
dc.language.isoturen_US
dc.publisherHatay Mustafa Kemal Üniversitesien_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectMikrobiyolojien_US
dc.subjectMicrobiology ; Veteriner Hekimliğien_US
dc.subjectGeni?lemi? spektrumlu beta-laktamazen_US
dc.subjectEscherichia colien_US
dc.subjectsığıren_US
dc.subjectExtended spectrum beta-lactamaseen_US
dc.subjectEscherichia colien_US
dc.subjectcattleen_US
dc.titleSığırlarda geniş spektrumlu beta-laktamaz sentezleyen Escherichia coli prevalansının belirlenmesien_US
dc.title.alternativeDetermination of the prevalence of extended spectrum beta-lactamase producing escherichia coli in cattleen_US
dc.typeMaster Thesisen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
340736.pdf
Boyut:
990.76 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir

Koleksiyon

Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tez Koleksiyonu