Güvercin (Columbia domestica) dışkılarında chlamydia psittaci ompa geninin araştırılması ve genotiplendirilmesi
| dc.authorid | 0000-0002-8837-0262 | en_US |
| dc.contributor.author | Altıntaş, Özlem | |
| dc.contributor.author | Ünal, Nilgün | |
| dc.contributor.author | Karagöz, Alper | |
| dc.contributor.author | Cantekin, Zafer | |
| dc.date.accessioned | 2021-12-23T06:29:17Z | |
| dc.date.available | 2021-12-23T06:29:17Z | |
| dc.date.issued | 2020 | en_US |
| dc.department | Veteriner Fakültesi | en_US |
| dc.description.abstract | Kanatlı klamidiyozisi evcil ve yabani kanatlılarda görülebilen, oldukça bulaşıcı ve sistemik bir hastalıktır. Hastalık etkeni Chlamydia psittaci, Chlamydiaceae familyasında, gram-negatif ve sadece hücre içerisinde yaşayabilen bir bakteridir. Etken insanlara, enfekte hayvanla temas ve dışkı aracılığıyla bulaşabileceği gibi etkeni içeren dışkı tozlarının solunmasıyla da bulaşabilir. Hastalık zoonoz bir karakter taşıdığı için halk sağlığı yönüyle de önemlidir. C.psittaci etkeninin hücre duvarı proteinlerine (OMP) karşı monoklonal antikorların kullanımıyla kanatlılarda altı (A-F), memelilerde iki (WC ve M56) serotip belirlenmiştir. Serotiplerde konak özgüllüğü vardır. Moleküler genotiplendirmede hücre duvarı proteinlerini kodlayan “major outer membrane protein/MOMP” ompA geni kullanılmaktadır. Bu çalışmada, Ankara’da on farklı ilçede bulunan aile işletmeciliği tarzında yetiştirilen, evcil güvercin dışkılarında C.psittaci ompA geni varlığının kış ve yaz mevsimlerinde araştırılması ve ompA geninin dizi analizi ile genotiplendirilmesi amaçlanmıştır. Çalışma kapsamında Ankara ilinde 10 farklı ilçede (Beypazarı, Haymana, Kızılcahamam, Çubuk, Pursaklar, Bala, Çankaya, Polatlı, Gölbaşı ve Merkez) bulunan kuşhanelerden iki farklı mevsimde 100 güvercin dışkı örneği toplanmıştır. Toplanan dışkı örneklerinden DNA eldesi klasik yöntemlerle yapılmıştır. Dışkıdan elde edilen DNA örneklerinde etkenin varlığı ompA geninin polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) analizi ile araştırılmıştır. PCR ile çoğaltılan hedef DNA ürünlerinden çalışmada kullanılan primerler ile ompA geninin çift yönlü dizi analizi yapılmıştır. Dizi analizi sonuçları uluslararası veri tabanı ile karşılaştırılarak serotiplendirme/ genotiplendirme yapılmıştır. Çalışmada 100 güvercin dışkı örneğinden altı örnekte C.psittaci ompA geni tespit edilmiştir. Bu pozitif örneklerin ikisi Bala (bir kış ve bir yaz dönemi numunesi), ikisi Haymana (bir kış, bir yaz dönemi numunesi), ikisi Gölbaşı (bir kış, bir yaz dönemi numunesi) ilçelerinden olmak üzere aynı kuşhanelerden farklı mevsimlerde izole edilmiştir. Bu çalışma ile güvercin dışkılarında C.psittaci’nin varlığı ile mevsim arasında bir fark belirlenmemiştir. Ayrıca, bu çalışmada pozitif örneklerde ompA geni dizi analiz sonuçlarının Dünya veri bankası ile karşılaştırıldığında bütün izolatların %100 oranında genotip B, %99 oranında da genotip E ile uyumlu olduğu görülmüştür. Türkiye’de, ompA geninin dizi analizi ile evcil güvercin kökenli C.psittaci genotipi ilk kez bu çalışmada belirlenmiştir. C.psittaci’nin zoonoz bir bakteri olması ve evcil güvercinlerde düşük oranda da olsa bulunması halk sağlığı açısından önemlidir. | en_US |
| dc.description.abstract | Avian chlamydiosis, is a highly contagious, systemic disease occuring in domestic and wild birds. Chlamydia psittaci, the causative agent of the disease, is a gram-negative bacterium in the Chlamydiaceaefamily that can only live within the cell. The agent can be transmitted directly to humans by contact with infected animals or feces of infected animals. It can also be transmitted by inhalation of fecal dust. Since the disease has a zoonotic character, it is also important in terms of public health. By using the monoclonal antibodies against cell wall proteins (OMP) of C.psittaci, six (A-F) and two (WC and M56) serotypes were determined in mammals. The aim of this study was to investigate and genotype the presence of C.psittaci ompA gene in domestic pigeon feces grown in family management style in ten different districts in Ankara in winter and summer seasons. Within the scope of the study, 100 pigeon stool samples were collected from birdhouses in 10 different districts of Ankara (Beypazari, Haymana, Kizilcahamam, Cubuk, Pursaklar, Bala, Cankaya, Polatli, Golbasi and city center) in two different seasons. DNA extraction from fecal samples was performed by classical methods. The presence of the agent in the extracted DNA samples was investigated by polymerase chain reaction (PCR) analysis of the ompA gene. Two-way sequence analysis of the ompA gene was performed with the primers used in the study from the target DNA products amplified by PCR. The results of sequence analysis were compared with the international database and serotyping/genotyping was performed. In the study, C.psittaci ompA gene was detected in 6 (6%) samples of 100 pigeon stool samples. Among these positive samples, two were from Bala (one sample from winter, one sample from summer), two were from Haymana (one sample from winter, one sample from summer) and two were from Golbasi (one sample from winter, one sample from summer); where the same agent was isolated in the same aviaries in different seasons. In this study, no difference was found between the presence of C.psittaci in pigeon droppings and season. In addition when the sequence analysis of the isolated samples were compared with the World database; all isolates were found to be 100% genotype B and 99% genotype E. In this study, the sequence analysis of the ompA gene of C.psittaci from domestic pigeon feces was determined for the first time in Turkey. Although the presence of C.psittaci in domestic pigeons is low, it is a zoonotic bacterium and is important for the public health. | en_US |
| dc.identifier.citation | ALTINTAŞ Ö,ÜNAL N,KARAGÖZ A,CANTEKİN Z (2020). Güvercin (Columbia domestica) Dışkılarında Chlamydia psittaci ompA Geninin Araştırılması ve Genotiplendirilmesi. Mikrobiyoloji Bülteni, 54(1), 144 - 153. Doi: 10.5578/mb.68757 | en_US |
| dc.identifier.doi | 10.5578/mb.68757 | en_US |
| dc.identifier.endpage | 153 | en_US |
| dc.identifier.issn | 0374-9096 | |
| dc.identifier.issue | 1 | en_US |
| dc.identifier.pmid | 32050885 | en_US |
| dc.identifier.scopus | 2-s2.0-85079334696 | en_US |
| dc.identifier.scopusquality | Q3 | en_US |
| dc.identifier.startpage | 144 | en_US |
| dc.identifier.trdizinid | 408409 | en_US |
| dc.identifier.uri | https://dx.doi.org/10.5578/mb.68757 | |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.12483/3374 | |
| dc.identifier.volume | 54 | en_US |
| dc.identifier.wos | WOS:000509478600012 | en_US |
| dc.identifier.wosquality | Q4 | en_US |
| dc.indekslendigikaynak | Web of Science | en_US |
| dc.indekslendigikaynak | Scopus | en_US |
| dc.indekslendigikaynak | PubMed | en_US |
| dc.indekslendigikaynak | TR-Dizin | en_US |
| dc.language.iso | tr | en_US |
| dc.publisher | Ankara Mikrobiyoloji Derneği | en_US |
| dc.relation.ispartof | Mikrobiyoloji Bülteni | en_US |
| dc.relation.publicationcategory | Makale - Uluslararası Hakemli Dergi - Başka Kurum Yazarı | en_US |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | en_US |
| dc.subject | Chlamydia psittaci | en_US |
| dc.subject | Dışkı | en_US |
| dc.subject | Avian | en_US |
| dc.subject | ompA | en_US |
| dc.subject | Polimeraz zincir reaksiyonu | en_US |
| dc.subject | Chlamydia psittaci | en_US |
| dc.subject | Feces | en_US |
| dc.subject | Polymerase chain reaction | en_US |
| dc.subject | Pigeon | en_US |
| dc.title | Güvercin (Columbia domestica) dışkılarında chlamydia psittaci ompa geninin araştırılması ve genotiplendirilmesi | en_US |
| dc.title.alternative | Investigation and genotyping of chlamydia psittaci ompa gene in pigeon (Columbia domestica) fece | en_US |
| dc.type | Article | en_US |
