Hatay ili nar alanlarında olası fitoplazma hastalıklarının moleküler yöntemlerle araştırılması

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorÇağlayan, Kadriye
dc.contributor.authorSarı, Kıvılcım
dc.date.accessioned2024-05-28T11:13:19Z
dc.date.available2024-05-28T11:13:19Z
dc.date.issued2015en_US
dc.departmentEnstitüler, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bitki Koruma Ana Bilim Dalıen_US
dc.description.abstractDünyada nar üretiminde Türkiye önemli bir paya sahip olup 2012 yılında 315.000 ton nar üretimi ile lider üretici ve ihracatçı konumundadır. Son yıllara kadar narlarda virüs ve benzeri etmen olarak sadece Cucumber mosaic virüs ve Hop stunt viroid saptanmıştır. Son yıllarda ise ülkemizde yürütülen çalışmalarla gerek Türkiye gerekse dünya için yeni kayıt niteliğinde olan Hatay ili nar alanlarında Grapevine leafroll associated virus-1, Aydın ilinde ise Aster yellows (16SrI-B) ve Stolbur (16SrXII-A) grubu fitoplazmalar saptanmıştır. Bu çalışmanın amacı, nar yetiştiriciliğinde önemli bir il olan Hatay'da ticari ve yabani nar plantasyonlarında olası fitoplazmaların varlığının moleküler yöntemlerle (PCR-RFLP analizleri) araştırılmasıdır. Bu çalışma kapsamında 2013-2014 yıllarında Hatay ilindeki 19 ticari nar bahçesi ile ev bahçelerinde bulunan nar ağaçlarından 154 bitkiden yaprak ve sürgün örnekleri toplanmıştır. Gözlenen en yaygın simptomlar ağaç tacında genel sararma, kızarma, gelişme geriliği, çoklu sürgün oluşumu, yapraklarda klorotik lekeler, meşe yaprağı oluşumu ve meyvelerde deformasyonlardır. Fitoplazma simptomu gösteren ağaçlardan toplanan yaprak ve sürgün örneklerinden kaliteli DNA izolasyonu amacıyla dört farklı yöntem denenmiştir. Nar dokularında bulunan yoğun fenolik bileşiklerden dolayı DNA izolasyonlarında saf ve kaliteli DNA elde etmede çok büyük sıkıntılar yaşanmıştır. Kullanılan yöntemlerden en uygunu Prince ve ark. (1993) tarafından geliştirilen yöntem olarak tespit edilmiş ve sadece bu yöntem ile kaliteli DNA izolasyonu mümkün olabilmiştir. En kaliteli DNA'lar kullanılarak yapılan PCR analizlerinde ise testlenen nar bitkilerinin hiçbirisinde herhangi bir fitoplazma tespit edilememiştir. Bununla birlikte gerek Hatay ilindeki narlarda fitoplazma benzeri belirtilerin gözlenmesi gerekse yürütülen başka bir çalışmada aydın ili nar alanlarında "Aster yellows" ve "Stolbur" grubu fitoplazmaların tespit edilmesi nedeniyle narlarda fitoplazma çalışmalarına devam edilmesinin gerekli olduğu düşünülmektedir.en_US
dc.description.abstractTurkey is one of the leading producers and exporter for pomegranate and the production reached 315.000 tons in 2012 that corresponds to one of the largest pomegranate economies in the World. To date only Cucumber mosaic virüs and Hop stunt viroid as a virus and virus-like agents have been reported to infect pomegranates. Recently some studies from our country showed the presence of Grapevine leafroll associated virus-1 in Hatay province , Aster yellows (16SrI-B) and Stolbur (16SrXII-A) group of phytoplasmas in Aydın pomegranate plantations which were the first report both for Turkey and also for the other countries. The aim of this study was to detect the presence of possible phytoplasmas in pomegranate trees grown in commercial orchards and home gardens by PCR/RFLP analysis. In frame of this study, 154 plant samples (leaves and shoots) were collected from 19 commercial pomegranate orchards and as well as from the homegardens in 2013-2014. The most common symptoms were general yellowing, reddening, less vigour growth, proliferation of the shoots, chlorotic spots and oak-leaf apperance on the leaves and fruit deformations. Four different methods were used for DNA isolation from symptomatic pomegrante leaves and shoots. Due to high content of polyphenols in pomegranate tissues, it was not easy to obtain pure and good quality DNA during the isolation process. Among the DNA isolation techniques, used in this study, the most suitable one was found as Prince et al. (1993) only from which good quality DNA was able to be isolated. When these DNAs were used in PCR analysis, not any phytoplasma was detected in tested pomegranate samples. However, phytoplasma surveys in pomegranate plantations should be carried on because of the recent reports of aster yellows and stolbur group of phytoplasmas in pomegranate samples collected from Aydın province and observing phytoplasma-like symptoms on pomegranates in Hatay.en_US
dc.identifier.endpage37en_US
dc.identifier.startpage1en_US
dc.identifier.urihttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=X-M9ZoIuIoNTj2P7iY13hROiQvKVt_j3sD0wJC0kDyUCAZwJd1nzFpi3ENGTI2mF
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12483/5191
dc.identifier.yoktezid408958en_US
dc.language.isoturen_US
dc.publisherHatay Mustafa Kemal Üniversitesien_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectZiraaten_US
dc.subjectAgricultureen_US
dc.titleHatay ili nar alanlarında olası fitoplazma hastalıklarının moleküler yöntemlerle araştırılmasıen_US
dc.title.alternativeStudies on possible phytoplasma diseases in pomegranate plantations in Hatay province by molecular techniquesen_US
dc.typeMaster Thesisen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
408958.pdf
Boyut:
2.13 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir

Koleksiyon

FBE Tez Koleksiyonu