Karboksamit grubu taşıyan antimon(III) komplekslerinin moleküler doking analizi

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorÇatikkaş, Berna
dc.contributor.authorAtaş, Feryal
dc.date.accessioned2024-05-27T17:29:17Z
dc.date.available2024-05-27T17:29:17Z
dc.date.issued2023en_US
dc.departmentEnstitüler, Fen Bilimleri Enstitüsü, Fizik Ana Bilim Dalıen_US
dc.description.abstractAnti-Leishmania özelliğine sahip L1: N-2-pirimidin-2-pirolinkarboksamit, L2: N-2-pirimidin-2-piperidinkarboksamit, L3: 5-kloro-N-(2-pirimidin)-2-tiofenkarboksamit ligandları ile antimon(III) bromür ve klorür komplekslerinin doking analizi yapılmıştır. Induced fit docking (IFD) yöntemi ile doking analizi için Schrödinger programı kullanılmıştır. Ayrıca, antimon(III) komplekslerinin ilaç özellikleri belirlemek için SwissADME programı kullanılmıştır. Bu tez çalışmasında, anti-Leishmania özelliklerini değerlendirmek için Leishmania infantum parazitinin tripanotion redüktaz enzimleri Protein Veri Bankasından (PDB numarası): 5EBK, 4NEW, 2YAU, 4APN ve 6ER5 hedef olarak seçilmiştir. Seçilen enzimlerle bileşikler arasındaki moleküler doking, moleküler mekanik/genelleştirilmiş Born yüzey alanı (MM/GBSA) ve absorpsiyon, dağılım, metabolizma, eliminasyon (ADME) çalışması ilk kez incelenmiştir. Komplekslerin aktif bölgede bağlanma enerjileri MM/GBSA yöntemi ile hesaplanmıştır. Doking ve MM/GBSA sonuçlarına göre bromo kompleksler kloro komplekslerden daha yüksek enerji değeri ile tripanotion redüktaz enziminin aktif bölgesine bağlanmıştır.en_US
dc.description.abstractDocking analysis of antimony(III) bromide and chloride complexes with L1: N-2-pyrimidin-2-pyrrolincarboxamide, L2: N-2-pyrimidin-2-piperidinecarboxamide, L3: 5-chloro-N-(2-pyrimidine)-2-thiophenecarboxamide ligands having anti-Leishmania properties was performed. Schrödinger program was used for docking analysis by induced fit docking (IFD) method. In addition, SwissADME program was used to determine the drug properties of antimony(III) complexes. In this thesis, to evaluate the anti-Leishmania properties, the Trypanothione reductase enzymes of the parasite Leishmania infantum from the Protein Data Bank (PDB ID): 5EBK, 4NEW, 2YAU, 4APN and 6ER5 were selected as targets. In this study, molecular docking, molecular mechanics generalized Born surface area (MM/GBSA) and absorption, distribution, metabolism, elimination (ADME) studies between the selected enzymes and compounds were investigated for the first time. The binding energies of the complexes in the active site were calculated by MM/GBSA method. According to docking and MM/GBSA results, bromo complexes bind to the active site of the enzyme Trypanothione reductase with higher binding energies than chloro complexes.en_US
dc.identifier.endpage62en_US
dc.identifier.startpage1en_US
dc.identifier.urihttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=a0OMTmEd_3mfOBxT8SiBTGe5bme6mI2jxEZ5nVSDNawJ2cT1PsMlIEYembSwnQmR
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12483/4282
dc.identifier.yoktezid811887en_US
dc.language.isoturen_US
dc.publisherHatay Mustafa Kemal Üniversitesien_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectFizik ve Fizik Mühendisliğien_US
dc.subjectPhysics and Physics Engineeringen_US
dc.titleKarboksamit grubu taşıyan antimon(III) komplekslerinin moleküler doking analizien_US
dc.title.alternativeMolecular docking analysis of antimon(III) complexes containing carboxamide groupen_US
dc.typeMaster Thesisen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
811887.pdf
Boyut:
2.3 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir

Koleksiyon

FBE Tez Koleksiyonu