Bazı pamuk çeşitlerinin ISSR markörleri ile karakterizasyonu
dc.authorid | 0000-0001-6270-8184 | en_US |
dc.authorid | 0000-0001-5877-7830 | en_US |
dc.contributor.author | Şahin, Cenk Burak | |
dc.contributor.author | İşler, Necmi | |
dc.contributor.author | Rustamova, Vafa | |
dc.date.accessioned | 2021-09-02T07:59:28Z | |
dc.date.available | 2021-09-02T07:59:28Z | |
dc.date.issued | 2020 | en_US |
dc.department | Ziraat Fakültesi | en_US |
dc.description.abstract | Bu çalışmada, kültürü yapılan 30 pamuk çeşidi (Gossypium hirsutum L.) arasındaki genetik ilişkinin ISSR yöntemi kullanılarak belirlenmesi hedeflenmiştir. Otuz pamuk çeşidinde polimorfizmin belirlenmesi amacıyla 24 ISSR primeri 8 pamuk çeşidinde test edilmiştir. Primerlerin yalnızca 9 tanesi PCR ürünü oluşturmuş ve sonraki çalışmalar bu primerlerle sürdürülmüştür. Seçilen 9 adet ISSR primeri 30 adet pamuk çeşidinde toplam 41 bant oluştururken bu bantlardan ortalama 22.3 tanesinin polimorfik olduğu saptanmış, primer başına polimorfik bant sayısı ortalama 2.5 olarak gerçekleşmiştir. Araştırmada kullanılan tüm primerler pamukta polimorfik bant üretirken, polimorfizm oranı primerlere bağlı olarak %6 ile %89 arasında değişim göstermiştir. ISSR primerlerine ilişkin polimorfik bilgi içeriği değerleri 0.19 ile 0.68 aralığında değişim göstermiş ve ortalama 0.49 olmuştur. Çeşitler arası ortalama Jaccard benzerlik katsayısı 0.77 olarak bulunurken, UPGMA kümeleme analiz sonucu 30 pamuk çeşidi genetik yakınlık açısından 2 ana kümeye ayrılmıştır. | en_US |
dc.description.abstract | This study was conducted to determine the genetic diversity in 30 cotton (Gossypium hirsutum L.) cultivars extensively cultivated in Turkey by using ISSR DNA molecular markers. To investigate the genetic diversity in 30 cotton varieties by ISSR molecular marker, 24 ISSR primers were screened in 8 varieties. Overall, 9 of 24 which produced a PCR product were selected according their polymorphism level. These ISSR primers totally produced 41 bands, and 22.3 were polymorphic. The percentage of polymorphic bands per primer was detected as 2.5. The rate of polymorphism depending on the primers ranged between 6% and 89%. Average polymorphism information content was 0.49, with minimum PIC 0.19 and maximum PIC 0.68. While the Jaccard similarity coefficient between the genotypes was detected as 0.77, 30, cotton varieties were grouped within two main clusters in respect to genetic similarity based on UPGMA analyses. | en_US |
dc.identifier.citation | ŞAHİN C. B,İŞLER N,RUSTAMOVA V (2020). Bazı Pamuk Çeşitlerinin ISSR Markörleri İle Karakterizasyonu. KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi, 23(1), 108 - 116. | en_US |
dc.identifier.doi | 10.18016/ksutarimdoga.vi.567725 | en_US |
dc.identifier.endpage | 116 | en_US |
dc.identifier.issn | 2619-9149 | |
dc.identifier.issue | 1 | en_US |
dc.identifier.startpage | 108 | en_US |
dc.identifier.trdizinid | 395759 | en_US |
dc.identifier.uri | https://dx.doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.567725 | |
dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.12483/3290 | |
dc.identifier.volume | 23 | en_US |
dc.identifier.wos | WOS:000530167400014 | en_US |
dc.identifier.wosquality | N/A | en_US |
dc.indekslendigikaynak | Web of Science | en_US |
dc.indekslendigikaynak | TR-Dizin | en_US |
dc.language.iso | tr | en_US |
dc.publisher | Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi | en_US |
dc.relation.ispartof | KSÜ Tarım ve Doğa Dergisi | en_US |
dc.relation.publicationcategory | Makale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı | en_US |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | en_US |
dc.subject | Pamuk | en_US |
dc.subject | Gossypium hirsutum L. | en_US |
dc.subject | Genetik çeşitlilik | en_US |
dc.subject | ISSR | en_US |
dc.subject | Cotton | en_US |
dc.subject | Genetic diversity | en_US |
dc.title | Bazı pamuk çeşitlerinin ISSR markörleri ile karakterizasyonu | en_US |
dc.title.alternative | Characterization of some cotton varieties using ISSR markers | en_US |
dc.type | Article | en_US |