Turunçgil antraknoz etmeni Colletotrichum gloeosporioides’in LAMP (Loop-Mediated Isothermal Amplification) tekniği kullanılarak hızlı tanısı

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorUysal, Aysun
dc.contributor.authorKurt, Şener
dc.date.accessioned2024-09-19T16:21:04Z
dc.date.available2024-09-19T16:21:04Z
dc.date.issued2020
dc.departmentHatay Mustafa Kemal Üniversitesien_US
dc.description.abstractTurunçgilde antraknoz hastalığı sürgünlerde geriye doğrukuruma, yapraklarda leke, erken dönem yaprak ve meyvedökümleri, meyvelerde antraknoz belirtileri şeklinde ortayaçıkmaktadır. Antraknoz etmeni Colletotrichum gloeosporioides,ülkemizde özellikle limon başta olmak üzere birçok turunçgiltür ve çeşitlerinde şiddetli enfeksiyonlara yol açmaktadır.C. gloeosporioides fungal patojeninin tanısı, morfolojik,moleküler yöntemler ve proteine dayalı spektrum analizleriile yapılabilmektedir. Bu çalışma, LAMP tekniğini kullanarakTurunçgil antraknoz etmeni C. gloeosporioides’in hızlı tanısınıgerçekleştirmek için yürütülmüştür. LAMP yöntemi içinspesifik primerler, C. gloeosporioides türünün gen dizileri hergen bölgesine özgü primer setleri (F3/B3 ve FIP/BIP) ‘PrimerExplorer V3’ adlı bilgisayar programı (http://primerexplorer.jp/e) kullanılarak tasarlanmıştır. LAMP reaksiyonunda kullanılmak üzere tasarlanan primerlerin özgüllükleri C.gloeosporioides’in 3 farklı izolatları ile Fusarium solani’ninFs4 izolatı olmak üzere toplam 3 DNA örneği kullanılarakdeğerlendirilmiştir. PCR çalışmasında genomik DNA 1 ng µl-1,LAMP çalışmasında 10 fg µl-1 miktarında kullanılmıştır. Sonuçolarak, floresan boya ile incelendiğinde, C. gloeosporioidesizolatlarının bulunduğu tüplerde parlama olmuştur. Ancak, F.solani’nin bulunduğu tüpte parlama gözlenmemiştir. LAMPanalizinin C. gloeosporioides’den elde edilen genomik DNA’yıbaşarıyla tespit ettiğini göstermiş, fakat F. solani’den eldeedilen genomik DNA’yı tespit edememiştir. LAMP tekniği ile 2saat süren bir analiz sonucunda elde edilen başarılı sonuçlarlakısa süre içerisinde patojenin varlığı tespit edilmiştir.en_US
dc.identifier.doi10.16955/bitkorb.656046
dc.identifier.endpage32en_US
dc.identifier.issn0406-3597
dc.identifier.issn1308-8122
dc.identifier.issue3en_US
dc.identifier.startpage25en_US
dc.identifier.trdizinid429549en_US
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.16955/bitkorb.656046
dc.identifier.urihttps://search.trdizin.gov.tr/tr/yayin/detay/429549
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12483/15576
dc.identifier.volume60en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.language.isotren_US
dc.relation.ispartofBitki Koruma Bültenien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.titleTurunçgil antraknoz etmeni Colletotrichum gloeosporioides’in LAMP (Loop-Mediated Isothermal Amplification) tekniği kullanılarak hızlı tanısıen_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
15576.pdf
Boyut:
989.98 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin / Full Text
İndir

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu