Sığırlarda GSBL ve AmpC sentezleyen Escherichia coli'nin prevalansı ve karakterizasyonu

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorAslantaş, Özkan
dc.contributor.authorElmacıoğlu, Sibel
dc.contributor.authorYılmaz, Ebru Şebnem
dc.date.accessioned2019-07-16T16:01:16Z
dc.date.available2019-07-16T16:01:16Z
dc.date.issued2017
dc.departmentHatay Mustafa Kemal Üniversitesien_US
dc.description.abstractBu çalışmada, Hatay ilinde sığırlarda genişlemiş spektrumlu ?-laktamaz (GSBL) ve/veya plazmid aracılı AmpC tip ?-laktamaz (AmpC) sentezleyen E. coli'nin prevalansının belirlenmesi hedeflendi. Bu amaçla, sağlıklı görünüşlü 312 sığırdan rektal sıvab örneği toplandı. Fenotipik GSBL sentezi disk kombinasyon metodu ve çift disk sinerji testi ile ?-laktamaz (blaCTX-M, blaCMY-2, blaSHV, blaOXA ve blaTEM) ve plazmid aracılı kinolon direnç (PAKD) genleri (qnrA, qnrB, qnrS ve aac(6')-Ib) polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ve daha sonra sekans analizi ile araştırıldı. Ayrıca, GSBL ve/veya AmpC sentezleyen E. coli izolatlarının antimikrobiyal duyarlılıkları disk difüzyon metodu ile filogenetik gruplarının belirlenmesi ise PZR ile incelendi. Yirmialtı izolat (%8.3) GSBL üretimi yönünden fenotipik testlerle pozitif bulundu. Bu izolatlarda blaCTX-M-15 (n= 12), blaCTX-M-1 (n= 11), blaCTX-M-3 (n= 2) ve blaCMY-2 (n=1) genleri belirlendi. PAKD genleri 11 (%42.3) ESBL sentezleyen E. coli izolatında saptandı ve bu izolatlar sadece aac(6')-Ib-cr ve qnrS1 genleri yönünden pozitif bulundu. İzolatlarının 22'si (%84.6) çoğul direnç fenotipi gösterdi. GSBL/AmpC sentezleyen E. coli izolatlarının B1 (%50), A (%34.6) ve D (%15.4) filogruplarına ait olduğu görüldü. Bu çalışma ile, ilk kez Türkiye'de sığırlarda CTX-M-15, CTX-M-3, CTX-M-1 ve CMY-2 tip ?-laktamaz sentezleyen E. coli varlığı ve bu izolatların bazılarında aac(6')-Ib-cr ve qnrS1 genlerinin birlikte bulunduğu gösterilmiştir.en_US
dc.description.abstractIn this study, it was aimed to determine the prevalence of extended spectrum ?-lactamase (ESBL) and/or AmpC type ?-lactamase (AmpC) producing Escherichia coli from cattle in Hatay. For this purpose, 312 rectal swabs samples were collected from apparently healthy cattle. ESBL production was phenotypically investigated by disc combination method and double disc synergism test and ?-lactamase genes (blaCTX-M, blaCMY-2, blaSHV, blaOXA, and blaTEM) and plasmid mediated quinolone resistance (PMQR) genes (qnrA, qnrB, qnrS and aac(6')-Ib) were screened by polymerase chain reaction (PCR) and subsequent sequence analysis. Antimicrobial susceptibility of the isolates were determined using disc diffusion method and their phylogenetic groups were also searched by PCR. Twenty six (8.3%) isolates were found to be ESBL producer by phenotypic tests. The following ESBL/AmpC genes were detected: blaCTX-M-15 (n= 12), blaCTX-M-1 (n=11), blaCTX-M-3 (n=2), and blaCMY-2 (n=1). PMQR genes were detected in 11 (42.3%) ESBL producing E. coli isolates and these isolates were only positive for aac(6')-Ib-cr and qnrS1 genes. Twenty two (84.6%) of the isolates exhibited multidrug resistance (MDR) phenotype. ESBL/AmpC producing E. coli isolates were observed to be belonged to B1 (50%), A (34.6%) and D (15.4%) phylogroups. This study was the first to describe the presence of CTX-M-15, CTX-M-3, CTX-M-1 and CMY-2 producing E. coli in cattle in Turkey and the co-existence of aac(6')-Ib-cr and qnrS1 genes in some isolates.en_US
dc.identifier.endpage67en_US
dc.identifier.issn1300-6045
dc.identifier.issue1en_US
dc.identifier.startpage63en_US
dc.identifier.urihttps://trdizin.gov.tr/publication/paper/detail/TWpVeE16SXpNdz09
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12483/2673
dc.identifier.volume23en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.language.isotren_US
dc.relation.ispartofKafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US]
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectVeterinerliken_US
dc.titleSığırlarda GSBL ve AmpC sentezleyen Escherichia coli'nin prevalansı ve karakterizasyonuen_US
dc.title.alternativePrevalence and characterization of ESBL- and AmpC-producing Escherichia coli from cattleen_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Aslantas, Ozkan 2017.pdf
Boyut:
290.55 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin/Full Text
İndir

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu