Yazar "Solmaz, Hasan" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 11 / 11
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Antibiotic susceptibility and molecular identification of antibiotic resistance genes of staphylococci isolated from bovine mastitis in Algeria(2015) Saidi, Radhwane; Cantekin, Zafer; Khelef, Djamel; Ergün, Yaşar; Solmaz, Hasan; Kaidi, RachidBu çalışma, Cezayir’de süt sığırlarındaki mastitis vakalarından izole edilen 21 stafilokok (10 Staphylococcus aureus ve 11 Koagulaz Negatif Stafilokok) suşunun Cezayir’de veteriner sahada sıklıkla kullanılan 12 antibiyotiğe karşı in vitro fenotipik ve genotipik direncinin belirlenmesi amacıyla yapıldı. Stafilokok izolatları disk difüzyon yöntemiyle test edildi. mecA, blaZ, aac-aph, ermA, ermC, tetK ve tetM direnç genleri ise PCR ile araştırıldı. Stafilokok izolatları penisilin (%95.23), oksasilin (%80.95), klindamisin (%80.95) ve eritromisine (%76.19) karşı yüksek oranda dirençli bulundu. 21 stafilokok izolatından 20 tanesinin metisilin dirençli ve çoklu antibiyotik direncine sahip olduğu belirlendi. Çoklu antibiyotik direncine sahip suşların bir çok antibiyotiğe karşı direnç paterni belirlendi antibiyotik I-XIII). Antibiyotik direnç genlerinin oranları ise mecA (%100), tetM (%100), blaZ (%42.85) şeklinde gerçekleşti. Bu çalışmada çoklu antibiyotik direncine de sahip metisilin dirençli stafilokokların yüksek prevalansı dikkat çekici idi. Bu çalışma Cezayir’de sığır mastitislerinden izole edilen stafilokoklarda metisilin direncini ortaya koyan ilk çalışmadır. Bu direncin ortaya konulması sürü bazında hastalığın tedavi, kontrol ve mastitis nedeniyle sürüden ayrılacak hayvanlar için karar verilmesine yardımcı olabilir.Öğe Antibiotic Susceptibility and Molecular Identification of Antibiotic Resistance Genes of Staphylococci Isolated from Bovine Mastitis in Algeria(Kafkas Univ, Veteriner Fakultesi Dergisi, 2015) Saidi, Radhwane; Cantekin, Zafer; Khelef, Djamel; Ergun, Yasar; Solmaz, Hasan; Kaidi, RachidThe study aimed to investigate the phenotypic and genotypic identification of in vitro antimicrobial susceptibility of 21 Staphylococci (10 Staphylococcus aureus and 11 Coagulase Negative Staphylococci) isolated from bovine mastitis to 12 antimicrobial drugs frequently using in veterinary medicine in Algeria. Isolates of staphylococci from bovine mastitis were tested for antibiotics with disc-diffusion method according to the National Committee for Clinical Laboratory Standards guidelines in the Mueller-Hinton agar, and resistant genes mecA, blaZ, aac-aph, ermA, ermC, tetK and tetM were detected by PCR. Staphylococci isolates showed high resistance to penicillin (95.23%), oxacillin (80.95%), clindamycine (80.95%), and erythromycin (76.19%) but, no resistance in all these strains was detected for gentamicin. Among 21 isolates of Staphylococci, 20 were found to be methicillin and multidrug resistant. Multidrug resistant strains exhibited several antibiogram patterns (antibiotic I to XIII). The distribution of antibiotic-resistant genes was mecA (100%) and tetM (100) followed by blaZ (42.85%). In the present study, the significant determination was the high prevalence of methicillin-resistant Staphylococci, which were resistant to multiple antibiotics. The finding of methicillin-resistant staphylococci from bovine mastitis is the first report in Algeria and revealed the status of resistant isolates in herd that might be helpful in treatment, controlling of resistant strains and for deciding culling of cows.Öğe Comparison of PCR and culture methods for diagnosis of subclinical mastitis in dairy cattle(2015) Cantekin, Zafer; Ergün, Yaşar; Doğruer, Gökhan; Sarıbay, Mustafa Kemal; Solmaz, HasanSığır mastitisleri süt sığırcılığı endüstrisinde ekonomik kayıpların en önemli nedenidir. Mastitiste etkeninin hızlı ve kesin tanısı hastalığın tedavisi ve kontrolü açısından çok önemlidir. Bu çalışmanın amacı subklinik sığır mastitislerinde etkenin tanısı için kültür ve polimeraz zincir reaksiyonu tekniklerinin karşılaştırılmasıdır. Bu amaçla, 540 ineğin California Mastitis Test ile muayenesinden sonra, pozitif bulunan 79 adet süt örneği, klasik kültür metodu ve direkt sütten yapılan polimeraz zincir reaksiyonu ile analiz edildi. Kırk üç örnekte her iki yöntemde de mikroorganizma belirlenirken, sadece 7 örnekte iki teknik arasından fark görüldü. Bu 7 örnekte kültür yöntemiyle sadece Koagülaz Negatif Stafilok belirlenirken, polimeraz zincir reaksiyonu ile Koagülaz Negatif Stafilok dışında S. dysgalactiae yönünden de pozitif bulundu. Bu çalışmanın sonuçları polimeraz zincir reaksiyonunun kültür yönteminden daha duyarlı olduğunu ve direkt olarak süt numunesinden hedef etkenin bir kaç saat içinde saptanabileceğini gösterdi. Hızlı ve güvenilir moleküler tekniklerin kullanımı mastitiste sürüden çıkarma veya tedavi etme konusunda hızlı karar verilebilmesinde yardımcı olabilir.Öğe Development of pmp Gene-Specific PCR Assay with A Host Specific Internal Control for Chlamydophila felis(Chulalongkorn Univ, 2014) Cantekin, Zafer; Solmaz, Hasan; Altug, Nuri; Ozmen, Gamze OzgeChlamydophila felis is the primary bacterial agent of conjunctivitis and upper respiratory disease in cats. Transmission of the disease requires close contact between cats. Polymerase chain reaction is a useful tool for detection of this organism. The aim of this study was to develop a polymerase chain reaction assay with an internal amplification control for the detection of C. felis. Primer pairs were designed specifically for polymorphic membrane protein gene of C. felis and cytochrome b gene of cat, and their specificity and sensitivity were examined. Primers specific for both genes were then multiplexed. In the simplex polymerase chain reaction analyses with 10-fold dilutions, C. felis DNA was detected with designed primers for polymorphic membrane protein genes up to 1.6 pg/mu l and cat DNA was demonstrated in all samples in the polymerase chain reaction. Moreover, in the multiplex polymerase chain reaction, C. felis DNA and cat DNA were detected together. These designed primers specific for C. felis might have potential for research on infections and shedding of this organism in cats as the internal control host specific primers might have potential for using internal control for detection of different microorganisms in cats.Öğe Development of pmp gene-specific PCR assay with a host specific internal control for Chlamydophila felis(Chulalongkorn University Printing House, 2014) Cantekin, Zafer; Solmaz, Hasan; Altug, Nuri; Ozmen, Gamze OzgeChlamydophila felis is the primary bacterial agent of conjunctivitis and upper respiratory disease in cats. Transmission of the disease requires close contact between cats. Polymerase chain reaction is a useful tool for detection of this organism. The aim of this study was to develop a polymerase chain reaction assay with an internal amplification control for the detection of C. felis. Primer pairs were designed specifically for polymorphic membrane protein gene of C. felis and cytochrome b gene of cat, and their specificity and sensitivity were examined. Primers specific for both genes were then multiplexed. In the simplex polymerase chain reaction analyses with 10-fold dilutions, C. felis DNA was detected with designed primers for polymorphic membrane protein genes up to 1.6 pg/?l and cat DNA was demonstrated in all samples in the polymerase chain reaction. Moreover, in the multiplex polymerase chain reaction, C. felis DNA and cat DNA were detected together. These designed primers specific for C. felis might have potential for research on infections and shedding of this organism in cats as the internal control host specific primers might have potential for using internal control for detection of different microorganisms in cats.Öğe A Duplex PCR for detection of S. aureus and Staphylococcus spp. from culture and bovine milk samples(2014) Cantekin, Zafer; Saidi, Radhwane; Solmaz, Hasan; Ergün, YaşarMastitis süt sığırcılığı endüstrisinin en fazla ekonomik kayba neden olan problemidir. Stafilokok türleri en sık izole edilen etkenler olup, Staphylococcus aureus ise süt sığırlarında en önemli kontagiyöz etkendir. Bu çalışmanın amacı stafilokok türleri ve S. aureus’un kültür ve süt örneklerinden teşhisi için ikili bir PZR tekniğinin geliştirilmesidir. Çalışmada pozitif kontrol olarak, S. aureus (ATCC 25923) ve S. epidermidis (ATCC 12228) DNA’sı kullanıldı. Geliştirilen tekniğin denenmesi amacıyla Veteriner Hekimlerce laboratuvarımıza gönderilen örneklerden bir adet koagulaz negatif stafilokok bir adet de S. aureus pozitif süt örneği klinik örnek olarak kullanıldı. Çalışmada sütten ve kültür örneklerinden stafilokok ve S. aureus’un teşhisi ve ayrımı için ikili ve hızlı bir PZR tekniği geliştirildi. Geliştirilen bu tekniğin stafilokok türleri ve S. aureus’un bir kaç saat içinde hem süt hem de kültür örneklerinden tanısı ve ayrımı için alternatif, güvenilir ve hızlı bir tanı yöntemi olarak özellikle sonuçların çiftlik bazında kullanılmak üzere klinik ve subklinik olgularda ineğin tedavi edilmesi ya da kesime gönderilmesine karar verilmesi amacıyla kullanılabileceği ortaya konuldu.Öğe Kış salkımı erken bozulan arı kolonilerinde paraziter ve bakteriyel patojenler(2012) Muz, Mustafa Necati; Yaman, Mehmet; Karakavuk, Muhammet; Solmaz, HasanKış salkımı, kovan içi sıcaklığın 14°C’nin altına düştüğü soğuk mevsimlerde, bal arılarının koloninin devamını sağlamak amacıyla sergiledikleri kümelenme davranışıdır. Çevre sıcaklığındaki mevsim dışı beklenmeyen artışlara, ana arı kaybı ve bazı patojenlere bağlı olarak salkım düzeni vaktinden önce bozulduğunda koloni kayıpları meydana gelmektedir. Bu araştırma Hatay yöresinde 2010-2011 yılı kışlatma sezonunda, kış salkımı erken bozulan kolonilerde paraziter ve bakteriyel patojenlerin tespiti amacıyla yapılmıştır. Kış salkımının düzenli sürdürülemediği gözlenen kolonilerde Varroa destructor tanısı için sıvı kavanozda çalkalama metodu, Nosema sporları için abdominal homojenizasyon metodu, Paenibacillus larvae için bakteriyel ekim (MYGP agar) ve PCR metotları kullanılmıştır. Hatay yöresindeki altı değişik kışlatma alanında 30 farklı arılıktan örneklenen 900 koloninin tamamında V. destructor’a (%100), 90’nında Nosema sporlarına (%10) ve 72’sinde Amerikan Yavru Çürüklüğü hastalığı etkeni P. larvae’ya (%8) rastlanmıştır. Sonuç olarak, kış salkımının erken bozulduğu kolonilerde kışlatma kayıplarının %30 düzeyine ulaştığı tespit edilmiştir. Bu kayıplardan sorumlu tutulan hava sıcaklığındaki ani değişimlerin yanında bakteriyel ve paraziter patojenlere de ciddi oranlarda rastlanmıştır.Öğe PCR ASSAY WITH HOST SPECIFIC INTERNAL CONTROL FOR STAPHYLOCOCCUS AUREUS FROM BOVINE MILK SAMPLES(Univ Sv Kiril & Metodij Skopje, Fak Veterinarna Medicina, 2015) Cantekin, Zafer; Ergun, Yasar; Solmaz, Hasan; Ozmen, Gamze Ozge; Demir, Melek; Saidi, RadhwaneStaphylococcus aureus is considered as one of the most important and common pathogens of bovine mastitis. Polymerase Chain Reaction is frequently proposed in the diagnosis of S. aureus directly from milk samples instead of classical culture. However, false-negative results may occur in the polymerase chain reaction analysis performed directly from clinical material. For the purpose of disclosing the false negative results, the use of internal amplification controls can be beneficial. Therefore, in this study a new polymerase chain reaction technique with host specific internal amplification control was developed by optimizing S. aureus-specific primers in combination with bovine specific primers. The effectiveness of the developed technique in this study was attempted in milk samples from bovine subclinical mastitis. This technique has the potential to detect S. aureus from bovine milk samples or dairy products.Öğe Presence of Antibiotic Resistance Genes in Staphylococci Isolated From Bovine Subclinical Mastitis(Sivar-Soc Italiana Veterinari Animali Reddito, 2024) Cantekin, Zafer; Ozmen, Gamze Ozge; Demir, Melek; Er, Zeynep Yilmaz; Gurturk, Kemal; Solmaz, Hasan; Ekin, Ismail HakkiThe prevalence of antibiotic resistance increases rapidly worldwide, and the primary culprit is represented by their widespread use. Subclinical mastitis is the leading cause of most antibiotic treatment, representing also one of the significant problems of bovine herd management. One of the main causes of subclinical mastitis is Staphylococcus aureus. Therefore, the determination of antibiotic resistance against Staphylococcus aureus is an essential step in the treatment of subclinical mastitis. The aim of this study was to identify antibiotic resistance genes in staphylococci obtained from cases of bovine subclinical mastitis in three provinces and the relationship between antibiotic resistance and ease of antibiotic availability (Burdur, Hatay and Van) in Turkey. In total, 283 isolates (Burdur, n = 36; Hatay, n = 47; Van, n = 200 isolates) were studied. The isolates were first identified as Staphylococcus aureus and/or non-aureus staphylococci (NAS) by conventional phenotypic methods, and the species was then confirmed by a multiplex polymerase chain reaction (PCR). A simplex PCR assay was performed to detect antibiotic resistance genes (mecA, mecC, aacA-aphD, ermA, ermB, ermC, tetK, tetM and blaZ). Among the isolates from all three provinces, the blaZ gene was the most prevalent antibiotic resistance gene, present in 43 out of 156 (28%) NAS isolates, 27 out of 127 (21%) S. aureus isolates and 25% of all the isolates. In contrast, tetM was the most prevalent gene in the Hatay isolates, detected in 64% of all isolates. The mecA-gene was present in 10% of the NAS, and in 3% of the S. aureus isolates. The mecC and ermA genes were not detected in any of the isolates. This shows that antimicrobial resistance, as determined by PCR, is common in Staphylococcus isolates from mastitis in Turkey, and warrants systematic treatment protocols as well as the implementation of preventative strategies to reduce antimicrobial usage.Öğe Subklinik mastitisli inek sütlerinden izole edilen stafilokoklarda antibiyotik duyarlılığı ve plazmit varlığının araştırılması(2010) Çelik, Afşar; Solmaz, HasanÇalışmanın amacı, subklinik mastitisli inek sütlerinden izole edilen Stafilokok izolatlarının bazı antibiyotiklere duyarlılığının araştırılması ve izolatlarda plazmit varlığının belirlenmesidir. Bu amaçla, toplam 51 Stafilokok izolatı incelendi. İzolatlar subklinik mastitisli ineklerden alınan 173 süt örneğinden izole edildi. Bu izolatlardan 47 (%92.15)'si koagulaz negatif, 4 (%7.84)'ü ise koagulaz pozitif olarak değerlendirildi. İzolatlar, mastitiste sıklıkla kullanılan 6 farklı antibiyotiğe duyarlı bulundu. İzole edilen 51 adet Stafilokok izolatından 3 (%5.88)'ünün oksitetrasikline, 3 (%5.88)'ünün sulfametoksazol-trimetoprim kombinasyonuna, 6 (%11.76)'sının novobiyosin'e, 11 (% 21.56)'inin eritromisin'e, 24 (%47.05)'ünün penisilin-G'ye dirençli; 27 (%52.94)'sinin penislin-G'ye, 40 (%78.43)'ının eritromisin'e, 45 (%88.23)'inin novobiyosin'e, 48 (%94.11)'inin oksitetrasikline, 48 (%94.11)'inin sulfametoksazol-trimetoprim kombinasyonuna, 51 (%100.00)'inin amoksisilinklavulanik asit kombinasyonuna duyarlı olduğu tespit edildi. İzolatların 16 (%31.37) tanesinde plazmit tespit edildi. Plazmit taşıyan izolatın 1 (%6.25)'i eritromisine, 2 (%12.50)'si oksitetrasikline, 4 (%25.00)'ü penisilin-G'ye dirençli idi. İzolatların 12 (%75.00)'si penisilin-G'ye, 14 (%87.50)'ü oksitetrasikline, 15 (%93.75)'i eritromisin'e ve tamamının (%100) novobiyosin, amoksisilinklavulanik asit ve sulfametoksazol-trimetoprim kombinasyonlarına duyarlı bulundu. Sonuç olarak koagulaz negatif suşların 16 (%31.37)'sında plazmit tespit edilmesine rağmen, koagulaz pozitif suşlarda plazmit tespit edilmedi.Öğe Subklinik mastitisli keçi sütlerinden aerobik bakterilerin izolasyonu(2011) İlhan, Ziya; Taşal, İbrahim; Sağcan, Süleyman; Solmaz, HasanBu çalışmada, 148 adet subklinik mastitisli keçi sütü örneğinden aerobik bakteri izolasyonu amaçlandı. Konvansiyonel yöntemlere göre yapılan değerlendirmede, örneklerin 69’undan (%46.6) aerobik bir bakteri izole edilirken, 79’undan (%53.4) ise her hangi bir bakteri üremesi olmadı. Kültür pozitif örneklerin 42’sinden (%60.8) koagulaz negatif stafilokoklar (KNS), 11’inden (%15.9) Staphylococcus aureus, 11’inden (%15.9) Escherichia coli, 2’sinden (%2.9) Corynebacterium spp., 1’inden (%1.4) Streptococcus spp., 1’inden (%1.4) C. pseudotuberculosis ve 1’inden (%1.4) ise Aeromonas spp. izole edildi. Sonuç olarak, subklinik mastitisli keçi sütlerinden en yüksek oranda KNS izole edildi.